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求助：NDP 非正定义解决

作者 小鱼儿1013: 来源: 小木虫 300 6 举报帖子

求助：
提示NDP 原子有误如何处理？
空间群为手性 P21n

xiexiegewei
jibenyijingjiejue le

[ Last edited by 小鱼儿1013 on 2009-10-22 at 19:37 ] 返回小木虫查看更多

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精华评论

flyingwf

用 isor 命令试试
zhaoyangqufu

引用回帖:
Originally posted by flyingwf at 2009-9-3 18:07:
用 isor 命令试试

呵呵应该是EADP命令
yinpanchao

NDP表明该原子非正定，可能是你原子定错了。当然很多情况是因为数据收集不够造成了，出现这种情况没有关系，只要你觉得这个原子的归属完全没有问题。可以用ISOR将这个原子各向同性处理。当然上面的人说EADP也是有道理的，他是强制性的给这个原子指定一个较好的温度因子。但是用EADP可能会造成R因子的变化较大。如果你的结构本身R因子很低，可以用EADP，要不就用ISOR。
flyingwf

引用回帖:
Originally posted by yinpanchao at 2009-9-4 03:40:
NDP表明该原子非正定，可能是你原子定错了。当然很多情况是因为数据收集不够造成了，出现这种情况没有关系，只要你觉得这个原子的归属完全没有问题。可以用ISOR将这个原子各向同性处理。当然上面的人说EADP也是有 ...

学习了
，
zhaoyangqufu

引用回帖:
Originally posted by yinpanchao at 2009-9-4 03:40:
NDP表明该原子非正定，可能是你原子定错了。当然很多情况是因为数据收集不够造成了，出现这种情况没有关系，只要你觉得这个原子的归属完全没有问题。可以用ISOR将这个原子各向同性处理。当然上面的人说EADP也是有 ...

对！
xi2004

一般不用EADP.

首先看看是不是对称性定低了. 必要时用PLATON检查
然后看看是不是有坏点. 有时侯, 有些明显的坏点删除了就好了.
再看看模型有没有问题
还有吸收校正是不是没做好?
强点是不是太少.

实在找不出改进的办法了,
再用isor等restraints