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小鱼儿1013

金虫 (正式写手)

[交流] 求助：NDP 非正定义解决

求助 ：
   提示NDP 原子有误 如何处理 ？
空间群为手性  P21n









xiexiegewei   
jibenyijingjiejue le

[ Last edited by 小鱼儿1013 on 2009-10-22 at 19:37 ]
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世上有两件事不能等,一是行善,一是尽孝.莫等失去了才懂得珍惜
1楼 2009-09-03 17:47:01
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flyingwf

木虫 (小有名气)
用 isor 命令试试
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老实做人，踏实做事
2楼2009-09-03 18:07:50
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zhaoyangqufu

至尊木虫 (知名作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by flyingwf at 2009-9-3 18:07:
用 isor 命令试试

呵呵应该是EADP命令
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3楼2009-09-03 21:56:16
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yinpanchao

新虫 (小有名气)
★
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 9-8 02:13
NDP表明该原子非正定，可能是你原子定错了。当然很多情况是因为数据收集不够造成了，出现这种情况没有关系，只要你觉得这个原子的归属完全没有问题。可以用ISOR将这个原子各向同性处理。当然上面的人说EADP也是有道理的，他是强制性的给这个原子指定一个较好的温度因子。但是用EADP可能会造成R因子的变化较大。如果你的结构本身R因子很低，可以用EADP，要不就用ISOR。
赞一下(10人) 回复此楼
4楼2009-09-04 03:40:52
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flyingwf

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yinpanchao at 2009-9-4 03:40:
NDP表明该原子非正定，可能是你原子定错了。当然很多情况是因为数据收集不够造成了，出现这种情况没有关系，只要你觉得这个原子的归属完全没有问题。可以用ISOR将这个原子各向同性处理。当然上面的人说EADP也是有 ...

学习了。
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老实做人，踏实做事
5楼2009-09-04 08:48:09
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zhaoyangqufu

至尊木虫 (知名作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by yinpanchao at 2009-9-4 03:40:
NDP表明该原子非正定，可能是你原子定错了。当然很多情况是因为数据收集不够造成了，出现这种情况没有关系，只要你觉得这个原子的归属完全没有问题。可以用ISOR将这个原子各向同性处理。当然上面的人说EADP也是有 ...

对！
6楼2009-09-04 14:56:15
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 9-8 02:13
一般不用EADP.



首先看看是不是对称性定低了. 必要时用PLATON检查
然后看看是不是有坏点. 有时侯, 有些明显的坏点删除了就好了.
再看看模型有没有问题
还有吸收校正是不是没做好?
强点是不是太少.

实在找不出改进的办法了,
再用isor等restraints
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xi2004-emuch@163.com
7楼2009-09-04 15:08:06
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