箭头的方向代表转录的方向

箭头方法代表基因方向，从起始密码到终止密码。质粒上有多个基因，基因的方向不一样，所以就有不一样的箭头方向。

转录的方向，也就是转录的模板分别为DNA两条链中的一条。

箭头代表了启动的方向，如果一个图谱上有两个方向，可能是有两个启动子

转录的方向

这个是pET系列载体的阅读方法：
ori是复制起始点，细的黑箭头是几个不同的转录区，其箭头方向不同，说明每个表达产物（如kan抗性基因、LacI等）都有独立的promoter，有时与T7 promoter方向相反。粗的黑箭头是MCS，用于目的基因的插入，箭头方向表明目的基因的转录方向，它的转录方向可以与其它几个不同的转录区相同，也可以不同，如Kan抗性基因、LacI的方向是一样的，可能与调控相关，不同的载体是不一样的。一个载体可只看它的启动子到终止子那一段，其它的可以考虑少些，