请教各位好心人,指点一下: 在ChemDraw中绘制的大分子,如何转化成能直接导入Gaussian计算的文件格式。 谢谢啦,谢谢抽出宝贵时间指点一下,万分的感激! 返回小木虫查看更多
先导入到chem3d,然后再保存为gjf格式,应该是可以的,但是,你在chem3d里面检验立体结构是否正确
先导入到chem3d,然后再保存为gjf格式,我刚刚试了,出现的是乱码,貌似不行。 不过可以先用chem3d构建正确的立体结构,然后点击标题栏中的View,找到Cartesian Table 或者 Z-Matrix table 复制下直角坐标或者内坐标,打开 gaussian建立一个新的.gjf文件,将刚才复制下的坐标稍作修改(去掉数据中出现的括号),加上命令,就可进行高斯的运算,
谢谢一楼和二楼的同道人,谢谢谢谢!
问一下用chemdraw画一个 分子 然后保存为.mol文件 直接用gv打开 计算不行么?
用3d造gaussian输入文件是要创建,而不是保存。
还是用hyperchem到Gaussview比较好,或者直接用hyperchem
同意楼上,我也常用hyperchem到Gaussview,DNA、蛋白质这些大分子都很好画有模板的
先导入到chem3d,然后再保存为gjf格式,应该是可以的,但是,你在chem3d里面检验立体结构是否正确
先导入到chem3d,然后再保存为gjf格式,我刚刚试了,出现的是乱码,貌似不行。
不过可以先用chem3d构建正确的立体结构,然后点击标题栏中的View,找到Cartesian Table 或者 Z-Matrix table 复制下直角坐标或者内坐标,打开
gaussian建立一个新的.gjf文件,将刚才复制下的坐标稍作修改(去掉数据中出现的括号),加上命令,就可进行高斯的运算,
谢谢一楼和二楼的同道人,谢谢谢谢!
问一下用chemdraw画一个 分子 然后保存为.mol文件 直接用gv打开 计算不行么?
用3d造gaussian输入文件是要创建,而不是保存。
还是用hyperchem到Gaussview比较好,或者直接用hyperchem
同意楼上,我也常用hyperchem到Gaussview,DNA、蛋白质这些大分子都很好画有模板的