我也想知道这个问题

在量子化学中，没有电荷在哪个原子上的概念，只有整体的电贺和自旋多重度。只要在标题行中写入正确的电贺和自旋多重度即可。

输出文件的atom charge是用算出来得波函数用特定的方法得的

如果使用分子力学的方法，在gaussian手册中有指定特定原子电荷的命令，可以查一下

谢谢三楼的回复。
如果就是要考虑分子中某个原子带电时候的情况怎么办呢，比如酸碱催化时分子上某原子失去一个氢氧根负离子，使得该原子带正电，但是由于电荷被整个分子所分布，使得优化结构中，有时候非失氢氧根原子反而正电性更强，失氢氧根的原子甚至带负电荷，尽管整个分子构型可能是能量最低的，但是没办法由此结构继续讨论本应由该带电原子引起的后续反应了，比如该带电原子对其邻位原子的影响等。
此外，有时候想要通过scan的方法，把一个质子而不是氢原子从其所在的碳原子上拉开，该怎么完成呢。是不是用分子力学的方法在gaussian中也可以实现呢，还请指点，谢谢，

这个属于过渡态找寻吧，尚在研究中应该

可以计算一下NBO分析，看看电荷是哪个原子失去了。在分析下一步怎么做