有些是指或是嘌呤之一或是嘧啶之一；另一些是说不限制碱基类型。要看上下文内容，或者你把句子贴过来。对不起，我刚接到电话要去开会，没有办法等你的回复了，你贴上完整的句子我看看。

I,Y,M倒也是修饰碱基或修饰核苷的符号，如果是修饰碱基或修饰核苷，出现在PCR引物中也不是没有可能，下次给你发些修饰碱基或修饰核苷的文献。我忘了修饰碱基或修饰核苷符号有无R。

[ Last edited by 陈硕真 on 2007-9-27 at 09:53 ]

这些是简并碱基。
含有简并碱基的引物叫简并引物，一般用降落PCR来扩增。

多谢多谢！上午电脑不好一直没有看到。我看他就是做的兼并引物PCR。

Degenerate PCR

http://www.rtpcr.cn/html/degeneratepcr/20070616/64.html

[ Last edited by 陈硕真 on 2007-9-27 at 19:55 ]

http://www.protocol-online.org/p ... PCR/Degenerate_PCR/

1.Degenerate Base Expander

http://vsrp.uhnres.utoronto.ca/dBaseExpander.html

Please paste in query sequences with degenerate bases to expand the sequences into multiple sequences.

This may be useful for motif search purpose.
W=A or T S=C or G
R=A or G Y=C or T
K=G or T M=A or C
B=C, G or T
D=A, G or T
H=A, C or T
V=A, C or G
N=A, C, G, or T


2.需要补充说明的是：简并PCR的引物中可以有修饰碱基存在,比如:次黄嘌呤(Hypoxanthine)。

                                --------------黄留玉 主编  PCR最新技术原理、方法及应用
                                      化学工业出版社，2005，88-89。

     有些符号的意思还是要结合上下文的(contextual)意思才能确定。

[ Last edited by 陈硕真 on 2007-9-27 at 20:36 ]，