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吗子

金虫 (小有名气)

[求助] 重组质粒一直连接不上,求助。。。。 已有7人参与

我最近构建一个质粒,将目的基因片段(250bp),连接到表达载体上(1 5000 bp)。但是连接后涂扳一直没上出想要的菌落来。方法如下:

先将目的基因连接于T载体,然后同时用kpn 1 和 sac 1 双酶切 T载体 和表达载体,并凝胶电泳回收目的片段及双酶切后的表达载体,然后进行重组连接。
连接用的TAKARA T4酶 10ul体系。1ul 酶,1ul buffer,其余加载体和片段,试了很多比例(载体:片段=1:1,3:1,10:1,20:1 1:10 都没有成功),连接16℃过夜12-14h。

涂扳后16小时内基本不长什么菌落,或者长的话也很小根本不好挑,长大了挑做PCR要么阴性要么假阳性。做了快2个月了,一直不知道问题出在哪啊,都要崩溃了。特在此求助各位虫友啦。谢谢啦

附上我胶回收的2张图片,请大家帮忙分析一下啊,不胜感激。

重组质粒一直连接不上,求助。。。。
左边为双酶切的表达载体质粒,右边是目的片段.jpg


重组质粒一直连接不上,求助。。。。-1
胶回收后的电泳.jpg
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深秋
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吗子

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by evangelina at 2015-08-26 11:35:01
问题应该出在T4酶或者你的盘子

建议你做一个T4酶的阳性对照,例如用T4酶连接blunt end切的质粒,看能不能长

我的经验是一般很小的菌落都不是真的,可能你用的抗生素不对或者浓度太高

有时候insert如果带有 ...

T4酶换的是新的,培养基也是新的,做另一个克隆的时候也没有问题呢。
blunt end切的话最具怎么操作呢?
之前用这个表达载体也重组过了个质粒。而且抗生素已经减量了,但还是一样的结果。 我之前用的感受态是全式金的Trans1-T1 和Trans10,但是结果都这样。怎么知道插入片段是否有毒性呢?
先谢谢啦
深秋
3楼2015-08-26 12:17:08
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普通回帖

evangelina

无虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
吗子: 金币+20, ★★★很有帮助, 感谢你第一个解答我的问题 2015-08-26 12:18:24
问题应该出在T4酶或者你的盘子

建议你做一个T4酶的阳性对照,例如用T4酶连接blunt end切的质粒,看能不能长

我的经验是一般很小的菌落都不是真的,可能你用的抗生素不对或者浓度太高

有时候insert如果带有毒性也不好克隆,可以试试换个菌株 例如 JM109

祝你成功!
2楼2015-08-26 11:35:01
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huangxun2000

新虫 (初入文坛)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-08-27 23:00:38
也可能是胶电泳回收目的片段的问题,wash buffer 没有干导致体系有乙醇影响重组反应。或者洗脱液最好少加一些,尽量让浓度提高,洗脱液少些。
4楼2015-08-26 20:31:41
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吗子

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by huangxun2000 at 2015-08-26 20:31:41
也可能是胶电泳回收目的片段的问题,wash buffer 没有干导致体系有乙醇影响重组反应。或者洗脱液最好少加一些,尽量让浓度提高,洗脱液少些。

谢谢。这些因素都考虑过了的,我已经加大回收量多次过柱来提高浓度了,但一直没获得我要的阳性克隆啊。
深秋
5楼2015-08-27 19:36:44
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yigeerliu

银虫 (小有名气)

不知道楼主这个问题解决了吗?我现在也遇到同样的问题。做了好久了一直都无法获得目的宿主菌。
6楼2015-09-11 09:58:42
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xbshyy

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
吗子: 金币+5, 有帮助, 谢谢,我现在连接10ul,然后是把10ul,加入50ul感受态转化,16℃过夜;载体双酶切后跑电泳回收的,跑的时候还作了2个单酶切的对照和1个没有切的质粒,然后2个单酶切都切开了,双切的条带也和单切的一样变长了。转化应该是没有问题。换了酶实验还是没连上,我觉得应该是载体那出了问题。 2015-09-11 10:57:06
引用回帖:
3楼: Originally posted by 吗子 at 2015-08-26 12:17:08
T4酶换的是新的,培养基也是新的,做另一个克隆的时候也没有问题呢。
blunt end切的话最具怎么操作呢?
之前用这个表达载体也重组过了个质粒。而且抗生素已经减量了,但还是一样的结果。 我之前用的感受态是全式 ...

我建议你先将连接产物跑电泳,看看有没有连上。
如果连上了说明是转化的问题。一般50ul的感受态细胞加入2~5ul的连接产物,这样不会改变感受态细胞的生存环境,如果连接产物用多了的话也有可能不长菌落。
如果没有连接上的话,很可能是因为你的15000bp载体并没有切干净,所以连接效果不好。建议你重新酶切
7楼2015-09-11 10:30:06
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吗子

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by xbshyy at 2015-09-11 10:30:06
我建议你先将连接产物跑电泳,看看有没有连上。
如果连上了说明是转化的问题。一般50ul的感受态细胞加入2~5ul的连接产物,这样不会改变感受态细胞的生存环境,如果连接产物用多了的话也有可能不长菌落。
如果没有 ...

我的载体是20Ul酶切4-5个小时.是否可以考虑换成10ul体系切2小时然后一起回收呢?
深秋
8楼2015-09-11 10:59:23
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吗子

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by xbshyy at 2015-09-11 10:30:06
我建议你先将连接产物跑电泳,看看有没有连上。
如果连上了说明是转化的问题。一般50ul的感受态细胞加入2~5ul的连接产物,这样不会改变感受态细胞的生存环境,如果连接产物用多了的话也有可能不长菌落。
如果没有 ...

连接产物跑电泳是看不出来的,因为连接的效率本来就很低,所以还得做转化筛选阳性克隆。
深秋
9楼2015-09-11 11:21:43
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吗子

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by yigeerliu at 2015-09-11 09:58:42
不知道楼主这个问题解决了吗?我现在也遇到同样的问题。做了好久了一直都无法获得目的宿主菌。

我换了NEB的T4酶,结果还是和以前一样,没有连接上呢。你的是什么情况?可以说出来大家一起讨论哈
深秋
10楼2015-09-11 11:22:56
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