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(木虫生物专题讨论)之核酸提取纯化专题贴
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———————————————————————————————— 继续招帖子工,招聘链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=910794&fpage=1 ——————————————————————————————————— 不才经过半个多月的整理,核酸提取纯化专题终于完成了。 本专题共分两篇 一为技巧篇 二为解惑篇 其中每篇分别整理成三章: DNA,RNA(含mRNA)和质粒。 请各位多多支持! 如果你觉得你从中学到了一点东西, 就把它顶起来吧, 让更多的人从中获益~ ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() [ Last edited by raindrop8316 on 2008-8-19 at 08:44 ] |
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第一章 DNA提取与纯化 主题26:提植物DNA时出现的问题(上清液墨绿色) 链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=639732&fpage=156 解答1:wenyangapple 我们实验室的protocol是这样的,你参考一下,看看能不能有所启发。 200微升CTAB研磨;加300微升CTAB; 65度水浴20分钟;加氯仿-异戊醇(24:1)震荡,离心,取上清;加等体积异丙醇,离心弃上清;洗涤,溶解。 我估计是你用的提取液不好了。 解答2:wdf1980122 转速不够 解答3:wdgsmv58 离心时间和转速不够 解答4:henghengyouyou 深绿色的溶液是对的,你还要其他几步在去除蛋白等 解答5:如来神掌 提取液加少了 解答6: glenn_007 加入提取液后,再用氯仿-异戊醇抽提2~3次去除蛋白干扰。每次缓慢颠转50次左右,然后离心,就可以得到上清液了。 主题27:细菌基因组DNA为什么提不出来? 链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=627321&fpage=155 解答1:reasonspare 如果出现多糖等物质需要洗涤几次,推荐TES, 其他可以用生理盐水或者灭菌去离子水, 1 ok 应该 2 加入TE后加入 lysome 37 度 1 h 或 更长时间,或者反复冻融(-20- 20度)超声波也可以考虑)总之先打破细胞壁。 加如 pro K 1h 去蛋白 3 加入 SDS 后重复振荡,37 度 30min 或更长, 其他 不变, 解答2:hudong 请你检查一下你用的所有试剂,试剂出问题的话也是没有 DNA。如果是一点DNA都没有的话,那很可能是试剂出问题了。建议重换试剂试试,或同时用其它方法试试。还有,你是小提,不用摇那么多的菌,用试管摇5ml就够了。 解答3:fengkai6200 我是从肌肉组织提的dna。我加的SDS的量比你大,100ul10%SDS。在55度反应2小时。当然因为肌肉组织不好裂解,所以比提菌的DNA多加了SDS,提高了反应温度。 我觉得你可以适当的改变一下条件,加大点SDS的量,或延长反应的时间。 我这方法提取的DNA质量很好的,没有降解,做pcr的效果也很好的 解答4:li3564617 dna沉淀使用肉眼看不见的,你不妨提完后跑个电泳看看,上述方法应该没问题,我用上海生工的试剂盒用的方法根你的差不多,效果也不错。 我们用无水乙醇沉淀,加入等体积的无水乙醇,-20摄氏度放置10分钟,然后4度离心 解答5: edragonfly ctab和DNA在低浓度Na离子时会发生结合 具体浓度是多少不记得了 自己查一下 解答6:genehsy 第六步中可以加1/10体积的3mol/L的醋酸钠促进DNA沉淀。 另外还有一种简单的方法你可以试一试,收集菌体用TE悬浮后直接用等体积的苯酚:氯仿(1:1)混合液直接抽提,离心取上清液,醇沉即可。 解答7:wbz66 DNA提取之后是看不见的,能看见的是一些蛋白质的杂质,建议跑个电泳看一下最好 解答8:bbzhangzhang 一个超级高手经常提醒我,抽提,一定首先把菌或细胞器充分裂解! 我个人强烈建议你在适当的裂解步骤加上剧烈涡旋2min,其他步骤暂时不变,相信会有作用。另外我查了,“CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)是一种阳离子去污剂,可以从低离子强度的溶液中沉淀核酸和酸性多聚糖的特性,在这种条件下,蛋白质和中性多聚糖仍留在溶液里,在高离子强度的溶液里,CTAB与蛋白质和大多数酸性多聚糖以外的多聚糖形成复合物,只是不能沉淀核酸。因此,CTAB可以用于从大量产生粘多糖的有机体如植物以及某些革兰氏阴性菌(包括E.coli的某些株)中制备纯化DNA ”。你看盐离子浓度是否合乎CTAB结合与分离核酸的要求,再做调整 主题28:花生DNA提取出现的问题 链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=645796&fpage=153 解答1:deepbluewater 你换SDS法试试?或者用液氮法?其实CTAB法除多糖的效果较好,但是对样品要做些前处理,我作的样品在CTAB之前需要用乙醇溶液浸泡,你可以试试对样品进行前处理(例如乙醇溶液浸泡,PVP浸泡【但是PVP浸泡容易导致DNA浓度过低,琼脂糖凝胶检测时条带不明显】) 解答2:glenn_007 离心后,取上清电泳试试?我觉得你应该是提取到了 SDS法适合蛋白含量较高的样品,CTAB适合多糖成分含量较高的样品。视具体情况而定 主题29:细菌基因组DNA抽提的问题(多条带) 链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=662031&fpage=139 无解答 主题30:氧颗粒污泥总DNA提取(附电泳图) 链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=675053&fpage=138 解答1:xiaoyu1014126 你把土样都放冰箱里,有些能产芽孢的菌都产生芽孢,这对实验啊有影响啊? 解答2:lxlxyc CTAB/NaCL在温度低的情况下结晶,放在65摄氏度水浴,直到结晶彻底溶解。水浴时不停摇动。 |
11楼2008-08-15 17:29:48
I.技巧篇
2楼2008-08-15 17:13:35
3楼2008-08-15 17:15:07
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第三章 质粒提取与纯化 主题1:质粒DNA的分离纯化和鉴定 链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=142066&fpage=418 发帖人:okaysee 主题2:一步法提取质粒DNA 链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=202040&fpage=398 发帖人:aronxu 主题3:质粒DNA提取及琼脂糖凝胶电泳 链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=417117&fpage=295 发帖人:raoqun20 主题4:质粒DNA提取试验常见问题解答 链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=462010&fpage=270 发帖人:beingking 主题5:质粒DNA的分离、纯化和鉴定 链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=543443&fpage=219 发帖人:lgj7966 主题6:转一篇关于质粒DNA提取原理的很棒的文章 链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=772205&fpage=71 发帖人:wjswj 以下为付费下载部分 主题7:质粒DNA的提取及浓度检测 链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=595213&fpage=189 发帖人:applepie119 主题8:质粒快速提取试剂盒 链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=595209&fpage=189 发帖人:applepie119 主题9:质粒DNA的提取和纯化 链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=102712&fpage=429 发帖人:pzhangyh 主题10:质粒提取简介及问题分析 链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=666139&fpage=141 发帖人:yangym1123 |
4楼2008-08-15 17:17:49















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