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raindrop8316

金虫 (正式写手)


[资源] (木虫生物专题讨论)之核酸提取纯化专题贴

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继续招帖子工,招聘链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=910794&fpage=1
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不才经过半个多月的整理,核酸提取纯化专题终于完成了。

本专题共分两篇
一为技巧篇
二为解惑篇

其中每篇分别整理成三章:
DNARNA(含mRNA)质粒


请各位多多支持!

如果你觉得你从中学到了一点东西,
就把它顶起来吧,
让更多的人从中获益~


[ Last edited by raindrop8316 on 2008-8-19 at 08:44 ]
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raindrop8316

金虫 (正式写手)


第一章 DNA提取与纯化
主题26:提植物DNA时出现的问题(上清液墨绿色)
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=639732&fpage=156
解答1:wenyangapple  
我们实验室的protocol是这样的,你参考一下,看看能不能有所启发。
200微升CTAB研磨;加300微升CTAB; 65度水浴20分钟;加氯仿-异戊醇(24:1)震荡,离心,取上清;加等体积异丙醇,离心弃上清;洗涤,溶解。
我估计是你用的提取液不好了。
解答2:wdf1980122  
转速不够
解答3:wdgsmv58  
离心时间和转速不够
解答4:henghengyouyou  
深绿色的溶液是对的,你还要其他几步在去除蛋白等
解答5:如来神掌
提取液加少了
解答6: glenn_007  
加入提取液后,再用氯仿-异戊醇抽提2~3次去除蛋白干扰。每次缓慢颠转50次左右,然后离心,就可以得到上清液了。

主题27:细菌基因组DNA为什么提不出来?
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=627321&fpage=155
解答1:reasonspare  
如果出现多糖等物质需要洗涤几次,推荐TES, 其他可以用生理盐水或者灭菌去离子水,
1 ok
应该
2 加入TE后加入 lysome 37 度 1 h  或 更长时间,或者反复冻融(-20- 20度)超声波也可以考虑)总之先打破细胞壁。
加如 pro K 1h 去蛋白
3 加入 SDS 后重复振荡,37 度 30min 或更长,
其他 不变,
解答2:hudong  
请你检查一下你用的所有试剂,试剂出问题的话也是没有 DNA。如果是一点DNA都没有的话,那很可能是试剂出问题了。建议重换试剂试试,或同时用其它方法试试。还有,你是小提,不用摇那么多的菌,用试管摇5ml就够了。
解答3:fengkai6200  
我是从肌肉组织提的dna。我加的SDS的量比你大,100ul10%SDS。在55度反应2小时。当然因为肌肉组织不好裂解,所以比提菌的DNA多加了SDS,提高了反应温度。
我觉得你可以适当的改变一下条件,加大点SDS的量,或延长反应的时间。
我这方法提取的DNA质量很好的,没有降解,做pcr的效果也很好的
解答4:li3564617
dna沉淀使用肉眼看不见的,你不妨提完后跑个电泳看看,上述方法应该没问题,我用上海生工的试剂盒用的方法根你的差不多,效果也不错。
我们用无水乙醇沉淀,加入等体积的无水乙醇,-20摄氏度放置10分钟,然后4度离心
解答5: edragonfly
ctab和DNA在低浓度Na离子时会发生结合  具体浓度是多少不记得了  自己查一下
解答6:genehsy  
第六步中可以加1/10体积的3mol/L的醋酸钠促进DNA沉淀。
另外还有一种简单的方法你可以试一试,收集菌体用TE悬浮后直接用等体积的苯酚:氯仿(1:1)混合液直接抽提,离心取上清液,醇沉即可。
解答7:wbz66
DNA提取之后是看不见的,能看见的是一些蛋白质的杂质,建议跑个电泳看一下最好
解答8:bbzhangzhang  
一个超级高手经常提醒我,抽提,一定首先把菌或细胞器充分裂解!
我个人强烈建议你在适当的裂解步骤加上剧烈涡旋2min,其他步骤暂时不变,相信会有作用。另外我查了,“CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)是一种阳离子去污剂,可以从低离子强度的溶液中沉淀核酸和酸性多聚糖的特性,在这种条件下,蛋白质和中性多聚糖仍留在溶液里,在高离子强度的溶液里,CTAB与蛋白质和大多数酸性多聚糖以外的多聚糖形成复合物,只是不能沉淀核酸。因此,CTAB可以用于从大量产生粘多糖的有机体如植物以及某些革兰氏阴性菌(包括E.coli的某些株)中制备纯化DNA ”。你看盐离子浓度是否合乎CTAB结合与分离核酸的要求,再做调整

主题28:花生DNA提取出现的问题
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=645796&fpage=153
解答1:deepbluewater  
你换SDS法试试?或者用液氮法?其实CTAB法除多糖的效果较好,但是对样品要做些前处理,我作的样品在CTAB之前需要用乙醇溶液浸泡,你可以试试对样品进行前处理(例如乙醇溶液浸泡,PVP浸泡【但是PVP浸泡容易导致DNA浓度过低,琼脂糖凝胶检测时条带不明显】)
解答2:glenn_007
离心后,取上清电泳试试?我觉得你应该是提取到了
SDS法适合蛋白含量较高的样品,CTAB适合多糖成分含量较高的样品。视具体情况而定

主题29:细菌基因组DNA抽提的问题(多条带)
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=662031&fpage=139
无解答

主题30:氧颗粒污泥总DNA提取(附电泳图)
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=675053&fpage=138
解答1:xiaoyu1014126  
你把土样都放冰箱里,有些能产芽孢的菌都产生芽孢,这对实验啊有影响啊?
解答2:lxlxyc  
CTAB/NaCL在温度低的情况下结晶,放在65摄氏度水浴,直到结晶彻底溶解。水浴时不停摇动。
11楼2008-08-15 17:29:48
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raindrop8316

金虫 (正式写手)


I.技巧篇

第一章 DNA提取与纯化

主题1:特殊组织DNA的提取及鉴定
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=103984&fpage=428
发帖人:liyuanzhang007  

主题2:细菌基因组DNA的提取方法综述
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=154434&fpage=412
发帖人:zhao7749  

主题3:植物总DNA的提取方法
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=160249&fpage=411
发帖人:johnnyhuang  

主题4:DNA提取方法 影响提取质量的因素 提高提取质量的方法
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=162756&fpage=410
发帖人:cocohud  

主题5:种子DNA提取方法
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=324889&fpage=343
发帖人:收获的金秋

主题6:对一些DNA提取方法的总结
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=344670&fpage=287
发帖人:sunlei1981  

主题7:动物总DNA提取
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=448490&fpage=280
发帖人:xyz4718  

主题8:真菌DNA的提取
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=459036&fpage=273
发帖人:qiulilf  

以下为付费下载部分

主题9:DNA电泳常见问题分析
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=257556&fpage=373
发帖人:fhang0427  

主题10:SDS法:植物DNA的小量提取
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=579001&fpage=200
发帖人:shining-rose
主题11:DNA提取方法
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=192019&fpage=268
发帖人:zhaowei

主题12:动物肝脏DNA的提取
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=151532&fpage=410
发帖人:jiyuanyao  

主题13:细菌染色体DNA的大量提取与纯化
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=461067&fpage=272
发帖人:ls2046

主题14:石蜡包埋组织的DNA提取及其应用
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=587300&fpage=194
发帖人:applepie119

主题15:血液样本DNA的提取
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=730030&fpage=111
发帖人: 萧潇

[ Last edited by raindrop8316 on 2008-8-15 at 17:16 ]
2楼2008-08-15 17:13:35
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raindrop8316

金虫 (正式写手)


第二章 RNA提取与纯化

主题1:RNA抽提细节技巧小总结
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=840058&fpage=16
发帖人:xewangjie2004
主题2:RNA抽提指南
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=105429&fpage=428
发帖人:gene121  
主题3:提取悬浮细胞RNA
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=107141&fpage=427
发帖人:heck
主题4:病毒RNA提取实验方法
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=169004&fpage=408
发帖人:cocohud  
主题5:RNA操作中的一般要求
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=168997&fpage=408
发帖人:cocohud  

主题6:RNA提取实验方法流程
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=169006&fpage=407
发帖人:cocohud  
主题7:RNA操作注意事项与实验技巧
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=165085&fpage=359
发帖人:cocohud  
主题8:mRNA的制备
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=230087&fpage=390
发帖人:三生石126
主题9:mRNA提取、分离纯化
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=313004&fpage=349
发帖人:yoyoh0032  
主题10:RNA抽提中自备有机溶液的配制及保存问题
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=346525&fpage=317
发帖人:badger

主题11:植物组织RNA提取的难点及对策
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=204181&fpage=277
发帖人:canegump  
主题12:总RNA的非变性电泳检测
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=484702&fpage=258
发帖人:forest200195
主题13:总RNA的提取
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=739164&fpage=106
发帖人:zuolili213
主题14:RNA抽提细节技巧小总结
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=840058&fpage=3
发帖人:xewangjie2004
主题15:总RNA的提取
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=577045&fpage=86
发帖人:shining-rose

主题16:RNA抽提的技术及注意问题
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=695053&fpage=128
发帖人: 静水深流106  

以下为付费下载部分

主题17:RNA提取及常见问题分析
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=754342&fpage=98
发帖人:passion_jh
主题18:RNA提取心得
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=584469&fpage=196
发帖人:applepie119
主题19:RNA的提取
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=268042&fpage=310
发帖人:nmwhf  
主题20:从RNA抽提到电泳鉴定
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=550336&fpage=215
发帖人:游乐天

主题21:植物RNA提取过程中多糖干扰的对策
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=255239&fpage=375
发帖人:jimchen7909  
主题22:植物总RNA提取
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=595262&fpage=188
发帖人:applepie119
主题23:提取RNA的实验课件
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=109041&fpage=427
发帖人:sohu123456  
主题24:RNA的提取和cDNA合成原理和实验方法
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=169002&fpage=408
发帖人:cocohud  
主题25:霉菌总RNA的制备
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=351453&fpage=291
发帖人:microliu  

主题26:mRNA抽提操作手册
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=594155&fpage=184
发帖人:applepie119  
主题27:提取优质RNA的方法
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=418186&fpage=288
发帖人:raoqun20  
主题28:RNA抽提技术及注意事项
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=598276&fpage=169
发帖人:duduhua
主题29:提取优质RNA的方法
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=514684&fpage=147
发帖人:dhszheng

[ Last edited by raindrop8316 on 2008-8-15 at 17:17 ]
3楼2008-08-15 17:15:07
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raindrop8316

金虫 (正式写手)


第三章 质粒提取与纯化
主题1:质粒DNA的分离纯化和鉴定
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=142066&fpage=418
发帖人:okaysee  

主题2:一步法提取质粒DNA
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=202040&fpage=398
发帖人:aronxu  

主题3:质粒DNA提取及琼脂糖凝胶电泳
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=417117&fpage=295
发帖人:raoqun20  

主题4:质粒DNA提取试验常见问题解答
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=462010&fpage=270
发帖人:beingking  

主题5:质粒DNA的分离、纯化和鉴定
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=543443&fpage=219
发帖人:lgj7966

主题6:转一篇关于质粒DNA提取原理的很棒的文章
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=772205&fpage=71
发帖人:wjswj  

以下为付费下载部分

主题7:质粒DNA的提取及浓度检测
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=595213&fpage=189
发帖人:applepie119  

主题8:质粒快速提取试剂盒
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=595209&fpage=189
发帖人:applepie119
  
主题9:质粒DNA的提取和纯化
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=102712&fpage=429
发帖人:pzhangyh  

主题10:质粒提取简介及问题分析
链接:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=666139&fpage=141
发帖人:yangym1123
4楼2008-08-15 17:17:49
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