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123q明

金虫 (小有名气)

[求助] 提取质粒和摇菌时候的问题。。。。。。。。。。 已有4人参与

目的基因与表达载体连接后,挑取单菌落pcr鉴定正确,然后提取质粒酶切鉴定,但是菌液过夜培养一直不够浑浊(3ml接入400ul菌液),提取的质粒也不亮,酶切鉴定过一次,单双酶切结果一样,都是一条带,大小一样,我又将同管菌液,质粒PCR鉴定,目的条带也正确,不知道到底是什么原因??????哪位知道,跪求指点!
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QQ小木

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, MolEPI+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-07-25 20:00:39
123q明: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-08-19 13:00:59
单双酶切只有一条带,应该有两种可能,一是酶切根本就没有切断,可能是酶切的效率不行,建议使用口碑较好的品牌;二是你目的片段的分子量较大,切下来的碎片段很小,所以看不到碎片段的条带,这要你自己分析一下是那种情况。
    这里我还建议,你试试比较一下酶切后的条带大小和PCR鉴定的条带大小是不是差不多大,如果差不多大说明应该是酶切掉了。
    你说的菌液不浓,我不知道你是用的多大的容器,多少体积的培养液摇的,反正有一点你要注意,液体在容器里摇的幅度必须不能太小,太小的话就等于根本没有要起来;另外要的时候一般是在37摄氏度,220 RPM的转速下摇,当然这个条件说的是大肠杆菌,其它菌可能有不同的条件吧。
    就说这么多,希望对你有帮助!
10楼2015-07-25 09:56:43
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

董博士

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-07-25 20:00:28
就像3楼的建议,可以扩大培养试试,以前我也遇到过菌摇不起来,经常要16个小时才有浑浊,提取质粒浓度低,我的原因是因为我的慢病毒质粒太大了,将近1万bp,所以有人说质粒太大,菌就不好摇,后来扩大培养,做大提质粒,质粒浓度和纯度都还挺好的,不知道你的情况是不是和我一样
医学&统计学
4楼2015-07-24 15:35:22
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firthzhang

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-07-25 19:59:26
123q明: 金币+3 2015-08-19 13:01:12
你先试试将抗生素的浓度降低,还有你说的3ml菌加400,是在指管里?你换用大瓶50ml的摇菌,空间太小,菌体不宜生长,37度,180转,提质粒用的菌不要超过12h,在提质粒时最好将母种放置冰上
再出不来,我就去死!
3楼2015-07-24 11:20:56
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猛兽

木虫 (小有名气)

做PCR时用水做对照,看引物是否污染了母的基因
5楼2015-07-25 09:19:13
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普通回帖

a86052

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-07-25 19:59:32
123q明: 金币+2, 有帮助 2015-08-19 13:01:22
单双酶切后条带大小如何,片段大小是多少,如果比较少,你的质粒本身就少,是不是太少看不到切下的片段?纯属猜测哈~可以送个测序
2楼2015-07-24 09:34:24
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123q明

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 猛兽 at 2015-07-25 09:19:13
做PCR时用水做对照,看引物是否污染了母的基因

试过了,没有!
6楼2015-07-25 09:21:00
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123q明

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 董博士 at 2015-07-24 15:35:22
就像3楼的建议,可以扩大培养试试,以前我也遇到过菌摇不起来,经常要16个小时才有浑浊,提取质粒浓度低,我的原因是因为我的慢病毒质粒太大了,将近1万bp,所以有人说质粒太大,菌就不好摇,后来扩大培养,做大提质 ...

恩!我试试,你们接菌比例是多少呢
7楼2015-07-25 09:23:17
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123q明

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by firthzhang at 2015-07-24 11:20:56
你先试试将抗生素的浓度降低,还有你说的3ml菌加400,是在指管里?你换用大瓶50ml的摇菌,空间太小,菌体不宜生长,37度,180转,提质粒用的菌不要超过12h,在提质粒时最好将母种放置冰上

12h菌量太少,我们这边提取质粒一般14h
8楼2015-07-25 09:25:51
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Ailly950

新虫 (小有名气)

来看回复的…感谢大神们分享经验…

[ 发自小木虫客户端 ]
9楼2015-07-25 09:45:23
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