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一桶稀泥

木虫 (正式写手)

[求助] PBI121载体单酶切比双酶切的条带偏下? 已有1人参与

各位大侠,连接表达载体的困惑我很长时间了,之前一直将目的条带连接表达载体PBI121,每次都不长斑,即使长了,挑20个菌落PCR都有目的条带,但是质粒都提不出来,不知长出来的是什么?
    最近重新做,发现我单纯的PBI121单酶切和双酶切位置竟然不对,图1为我提取PBI121质粒的图片(质粒一直-20℃保存,我取20mlLB,加20ul菌液,加入20ul,50mg/ml的Kna,摇菌10h,已经能看出菌浑浊的很好);电泳条件:琼脂糖凝胶为1%,条件U=120,I=120,T=20min。泳带1:2K Marker;2-11为PBI121质粒。
图2为PBI121和目的条带的单酶切和双酶切图片,电泳条件:琼脂糖凝胶为3%,U=80,I=80,T=40min。
如图2:泳带1:2K Marker;2BI121 SmalI单酶切;3:PBI121 XbalI单酶切;4-13都是PBI121 的SmalI和XbalI双酶切;14:PBI121 XbalI单酶切;15:PBI121 SmalI单酶切;16:2Kmarker,17:15k Maker;18-20都是我目的基因的SmalI和XbalI的双酶切,目的基因大小为513bp。21:2Kmarker.昨天做的时候忘记点质粒了,所以可能缺少个对照,一会就去做,另外我目的基因没有做单酶切。15K marker跑剩4条带了。
根据图1:第9泳带和10泳带PBI121位置偏上,不知道什么原因,仔细看图,好像每个条带下面还有个弱弱的条带;请各位指点。
根据图2:单酶切的位置要比双酶切的位置偏上,但是都很干净,只有一条带,貌似切的很完全。而我的目的基因位置很正常,但是能看到胶口像是有条带,以前也遇到过这种问题,我再跑多长时间,这个带都不会下来,之前遇到的问题是我连接目的基因后挑20个菌落,PCR,20个菌落,有19个都是和泳带17-19的样子一样,只有一个没有,胶口很正常,跑了两次胶都是这样。提质粒,什么都没有,也让我很困惑。
谢谢大家了!!!!万分感谢!!!!!!

PBI121载体单酶切比双酶切的条带偏下?
图1pbi121质粒JPG.jpg


PBI121载体单酶切比双酶切的条带偏下?-1
图2.jpg
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半桶稀泥

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
一桶稀泥: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2015-12-15 22:55:38
你好,之前遇到和你类似的问题,现在问题解决了 ,是因为PBI121载体已经变成直链,有可能是你保存不当,或者摇菌时间过长。换个新的PBI121肯定没问题。
2楼2015-12-15 22:54:35
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一桶稀泥

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 半桶稀泥 at 2015-12-15 22:54:35
你好,之前遇到和你类似的问题,现在问题解决了 ,是因为PBI121载体已经变成直链,有可能是你保存不当,或者摇菌时间过长。换个新的PBI121肯定没问题。

谢谢你,这么长时间了,我已经知道是载体问题,但是还是谢谢你
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3楼2015-12-15 22:56:06
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