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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 退火温度怎么找
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iswearit

铁虫 (初入文坛)

[求助] 退火温度怎么找 已有1人参与

上游CCAAGATGCTTCAGTGTCCA
Tm(1M Na+)：68.2
Tm(50mM Na+)：46.6
下游GAAGCTCCATCCTCACAAGG
Tm(1M Na+)：70.3
Tm(50mM Na+)：48.7
顺便问下大家，Tm(1M Na+)和Tm(50mM Na+)有什么区别啊?
我该选择哪个Tm啊？
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先得到的未必是好的
1楼 2015-06-02 21:46:32
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
选择50mM Na+浓度时的Tm值
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2楼2015-06-02 22:34:00
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iswearit

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-06-02 22:34:00
选择50mM Na+浓度时的Tm值

直接用这个TM值吗

[ 发自小木虫客户端 ]
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先得到的未必是好的
3楼2015-06-02 23:48:51
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
iswearit: 金币+1, 引物合成公司提供的 2015-06-03 07:54:31
iswearit: 金币+1, 这个TM是厂家所明书上注明的 2015-06-03 10:27:27
引用回帖:
3楼: Originally posted by iswearit at 2015-06-02 23:48:51
直接用这个TM值吗
...

不知道你这个Tm值使用什么方法算得，比一般软件计算的值偏低，我认为用50-55℃应该都可以。
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4楼2015-06-03 00:31:28
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by iswearit at 2015-06-02 23:48:51
直接用这个TM值吗
...

可以用厂家的Tm值做退火温度，如果结果有非特异带，可以把退火温度提高到50-55℃。
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5楼2015-06-03 12:19:23
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