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qaz139687

新虫 (小有名气)

[求助] 着么判定一个基因是否拿到全长 已有1人参与

求大神指点啊  这是目前测序得到的序列  
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGCACGATTTACTAGGTTTTTGGGTTTTCGGCGAGACAATGTGTACATTATGGTTATGCATCGACGTTTTAAACTGTACAGCATCTATTTGGGGATTATGTACAATAGCTGTGGACCGCTACACTGCTACTATATACCCTGTGTGGTATTTTGAACGACGTTCTCCCGTCAGAGCCTTAATTTATATTATCTTTGTGTGGTTATTTTCTTTAATAGTATCATTTGCACCATTCATAGGATGGCGAGATATGATTCAGAACTTGTATCGGTATAACCCAAGAATAAACCGGTATGAATGCGTACTTTTTCAGACAGGAGGGTATGTAGTTTATTCTGCTATGGGCTCATTTGTCATACCAATTTTTCTAATGACATTTTTATATGTTAGAATATTCATAGTATTAAAGAAAAGAACAAGAATTTTGAAACCTCGCCATAAAAAGAAACATTGTAACATTGATAATGACAATGAAACAAGTTGTATTAATCCG
CATCCAGCTACAACATGCACAACTCAAATAGACTTACAACCTCCTATTGTCATGAAAGAC
AAATCCACACAAATTAGTCCGCTTCCTAAAAGACCTTTACGGAAATCTACAGAAGACCCC
AAGTTAAAAGGAAATAATCTTAATAACGAAAAAGATCTTAAAACTAACAGTTCGACAATG
TTGCTTACAGTAAGCAACGATGTGAAAGGATCAGCTGAACAGCAAACACAAGCTGGTCCT
AAAACAAAACAACCCGTGTCTGCAATGAACGGGAAGAAAAAGCACATTGAACCTAGTCGT
TCAACTGACGATAACGATGAGAACGGGATAGTAATGGACGACAGCTCCGGTGACACTGTC
AGTTATAAGGAAGAAAATATATGCTGCAGTGGATGTGCATGCAAGTCGTGTTCTCCTATG
TTCAATTGTTTGATTATAAAACGTTCTAATAAAAACAACAATAATCAGAGACGTGACAGC
GAAGGTCATAAATCTTTAAAAATTAAAAAAGGCAGTTCCTTGAAGAAACGTGCAATACAA
CTACGGAATAAAAGTATGACTGGTATAAAGAGTAAATATGAACTAAGAGAACAGAGAGCA
ACTAAAAGAATGGCAATAGTAATGGCATGTTTCTGTTTTTGTTGGATCCCTTTCCTATTT
ATGTATTTAATTCGAAGCTTCTGTGATAATTGTGAACTTGACATTCATATACAGGCTGCC
ATTATCTGGCTAGGATATGCCAACTCCGGTATAAATCCTATTTTATATACTCTATTCAAT
GATGACTTCCGCAGAGCCTTTGAGATAATTCTTGGAATTAGACGATCAAAACATAAGAAA
CGGAGACATTAGGAAATAAGTATGGTTATAGTAAAATATTCTTTTGTTTAAATATATAGGTAAGGAAATGAAATGTTTTATATTTTTCATTTGATAACACTACCACTATGACATGCAAAAAATGAGTACATTAACTACTAAAACTATAGAATCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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墨尔本机器

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2015-04-17 10:49:09
楼主你给出这么一段序列没有意义啊,要根据你研究的东西来判断,主要还是看Blast结果。你这个序列Blast后没有可信的结果,无意义
2楼2015-04-16 18:43:51
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qaz139687

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 墨尔本机器 at 2015-04-16 18:43:51
楼主你给出这么一段序列没有意义啊,要根据你研究的东西来判断,主要还是看Blast结果。你这个序列Blast后没有可信的结果,无意义

我做的事octopamine受体基因,比对出来不是有牡蛎的50%+吗,好像软体动物的比出来都不高的
3楼2015-04-17 13:40:26
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海边闲散人

新虫 (小有名气)

楼主,感觉应该是NCBI上面先用orf finder, 找到orf区,再用氨基酸序列做比对,因为氨基酸序列比核酸序列保守

发自小木虫Android客户端
4楼2018-01-15 22:15:57
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