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着么判定一个基因是否拿到全长 已有1人参与
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| 着么判定我记得基因是否拿到全长了？3端的话出现了好多AAAAA 可以判定为全长，文件里面蓝颜色的ORF框，着么判定5端是否全了呢？ |
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本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 章鱼胺受体基因全长.doc
2015-02-02 13:53:32, 13.5 K
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2楼2015-02-02 21:01:12
【答案】应助回帖
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myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2015-02-03 12:27:13
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文档中蓝色ORF是你自己定义的嘛？不知道你注意到没有，实际上ATG前端的碱基也能翻译出连续氨基酸并与后面同框！另外，你5端的数据是怎么获得的？根据从开始就出现连续同框情况，推测你的5端序列应该不是通过5-RACE获得的，很像是文库测序结果！而你定义的ORF的ATG很可能只是蛋白中部的蛋氨酸， 从序列5端开始翻译出氨基酸序列进行BLAST，结果跟牡蛎的章鱼胺受体同源性很高，匹配结果提示，N端还缺少100多个氨基酸， 更进一步讲，BLST提示你的章鱼胺受体貌似属于七次跨膜蛋白家族，理论上应该存在多个跨膜区。但分析你的ORF编码出的蛋白，只有2个跨膜区。 综上，我个人推测你的5端不完整，可能还缺500多bp，以上仅为个人意见，不排除你的5端已经完整的可能性！ [ 发自小木虫客户端 ] |
3楼2015-02-03 00:19:02
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