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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 获得一段碱基序列，应该是个未知基因，如何确定起始密码子和终止密码子
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njuzhangxin

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] 获得一段碱基序列，应该是个未知基因，如何确定起始密码子和终止密码子

如题，我已通过测序获得一段碱基序列，应该是个未知基因，其中有很多个ATG，想请教如何确定哪个位置才是起始密码子，还有终止密码子不是有三个么，UAA、UAG、UGA，如果三联体读下来，有好几种情况都符合ATG起始UAA、UAG、UGA终止的话，如何确定哪种情况是最有可能的基因序列呢？谢谢。
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1楼 2013-11-27 11:14:02
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
把你获得的序列，做一个翻译，3种可能性，获得的最长ORF的DNA片段，可能是编码区
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2013-11-27 12:37:14
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-11-27 12:45:18
把序列输到VECTOR里，查找ORF，会把全部可能的ORF找出来。
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3楼2013-11-27 12:42:08
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zh10246

铁杆木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
njuzhangxin: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2013-12-11 15:35:40
ORF Finder (Open Reading Frame Finder)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html
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4楼2013-11-27 19:12:22
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