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清晨初日

铜虫 (小有名气)

[求助] 分子生物新手求助大神答疑解惑 已有2人参与

一是文献报道mrgprx2这个基因只在人体内表达,大鼠小鼠不表达。但是为什么能够在genebank上检索到大鼠小鼠此基因的序列?
二是老师想让我从大鼠细胞中提取x2这个基因,我按照genebank上面检索的序列设计引物做RT-PCR,能得到吗?
三是有文献说人的x2这个基因和小鼠b2基因为orthologue,但是在ncbi blast显示这两个基因No significant similarity found,这是为什么?
现在觉得很是迷惑,请大家给点建议!我到底该怎样理清思路?
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学渣逆袭,都闪开
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清晨初日

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by ptttmt at 2015-03-30 00:07:07
怎么BLAST的,应该按蛋白序列BLAST
...

碱基序列

[ 发自小木虫客户端 ]
学渣逆袭,都闪开
7楼2015-03-30 07:59:18
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nubia

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
基因不表达不代表没这个基因序列,反转录PCR原则上可以得到基因cDNA序列。

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2015-03-29 18:54:35
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清晨初日

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by nubia at 2015-03-29 18:54:35
基因不表达不代表没这个基因序列,反转录PCR原则上可以得到基因cDNA序列。

嗯,但是blast的结果为何没有相似性呢?这说明什么?
学渣逆袭,都闪开
3楼2015-03-29 20:06:46
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ptttmt

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
小鼠中都不表达你做个什么RT-PCR,直接按基因序列合成引物,以基因组为模板做PCR

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2015-03-30 00:01:06
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