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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 核酸提取 » 分子生物新手求助大神答疑解惑
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清晨初日

铜虫 (小有名气)

[求助] 分子生物新手求助大神答疑解惑 已有2人参与

一是文献报道mrgprx2这个基因只在人体内表达，大鼠小鼠不表达。但是为什么能够在genebank上检索到大鼠小鼠此基因的序列？
二是老师想让我从大鼠细胞中提取x2这个基因，我按照genebank上面检索的序列设计引物做RT-PCR，能得到吗？
三是有文献说人的x2这个基因和小鼠b2基因为orthologue，但是在ncbi blast显示这两个基因No significant similarity found，这是为什么？
现在觉得很是迷惑，请大家给点建议！我到底该怎样理清思路？
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学渣逆袭，都闪开
1楼 2015-03-29 16:51:34
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nubia

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
基因不表达不代表没这个基因序列，反转录PCR原则上可以得到基因cDNA序列。

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2楼2015-03-29 18:54:35
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清晨初日

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by nubia at 2015-03-29 18:54:35
基因不表达不代表没这个基因序列，反转录PCR原则上可以得到基因cDNA序列。

嗯，但是blast的结果为何没有相似性呢？这说明什么？
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学渣逆袭，都闪开
3楼2015-03-29 20:06:46
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清晨初日

铜虫 (小有名气)
4楼2015-03-29 20:07:06
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ptttmt

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
小鼠中都不表达你做个什么RT-PCR，直接按基因序列合成引物，以基因组为模板做PCR

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5楼2015-03-30 00:01:06
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ptttmt

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 清晨初日 at 2015-03-29 20:06:46
嗯，但是blast的结果为何没有相似性呢？这说明什么？...

怎么BLAST的，应该按蛋白序列BLAST

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6楼2015-03-30 00:07:07
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清晨初日

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by ptttmt at 2015-03-30 00:07:07
怎么BLAST的，应该按蛋白序列BLAST
...

碱基序列

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学渣逆袭，都闪开
7楼2015-03-30 07:59:18
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