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jianghon

新虫 (初入文坛)

[求助] 一个有关转录组测序的问题 已有1人参与

最近做的转录组测序(无参考基因)的数据出来了,由于是新手不会分析,我想问一下,怎样根据给出的差异基因的序列片段确定这是什么基因及基因的功能。我把一些序列片段在NCBI上blast,总是没结果,难道都是新基因吗?
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444565008qq

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2015-03-26 10:47:58
有可能是新的,因为没有参考组,但是也有可能是测序时候拼接错误,我的也这样,看文献,找出你要的差异基因在去比对
2楼2015-03-24 13:13:00
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a2genomics

捐助贵宾 (初入文坛)


你需要de novo assembly,再做下游分析,可以看demo:  http://a2genomics.com/
3楼2015-04-04 08:12:50
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