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一个有关转录组测序的问题
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jianghon
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专业: 水产养殖学
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一个有关转录组测序的问题
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最近做的转录组测序(无参考基因)的数据出来了,由于是新手不会分析,我想问一下,怎样根据给出的差异基因的序列片段确定这是什么基因及基因的功能。我把一些序列片段在NCBI上blast,总是没结果,难道都是新基因吗?
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专业: 分子与进化生态学
【答案】应助回帖
★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流
2015-03-26 10:47:58
有可能是新的,因为没有参考组,但是也有可能是测序时候拼接错误,我的也这样,看文献,找出你要的差异基因在去比对
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2015-03-24 13:13:00
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性别: GG
专业: 细胞生物学研究中的新方法
你需要de novo assembly,再做下游分析,可以看demo: http://a2genomics.com/
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