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关于测序后基因分型的一些问题。。。求大神解答！ 已有1人参与
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本人对分子生物相关的一些东西都不太懂，只会做PCR来检测，但是老板要求要做到基因分型，查了一些文献，但是没有一个很好的思路所以来请教各位大神！ 我要对样本中的隐孢子虫SSU基因进行检测并且测序，最后是要鉴定到基因型。 首先，每种隐孢子虫就有很多的基因型，文献中所选择的基因型用于比对的基因型也不相同。那么我该如何从基因库里面选择出可用于我比对的这些基因型呢？其次，我直接把测序结果来BLAST，会出来20多个结果，identity也有99%，但是都是isolates，没有出现相应的基因型编号。那这样分到型了吗？ 最后，我想知道这个试验的步骤到底是怎样的？是我先用酶切确定我得到几个型再去找相应比对型呢？还是直接找来比对型进行比对，最后出结果？ 希望知道的大神告诉我该怎么做。。。从基因型的选择开始我就不会弄了。。。 |
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