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汕头大学海洋科学接受调剂
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Ergon

金虫 (著名写手)

[求助] 粗粒化建模请教--如何搭建可在lammps运行的模型 已有1人参与

各位大神,小弟想要做些粗粒化方面的模拟。有个论文是模拟粗粒化石墨烯的。高了好些天模型没搭建好。
想问的问题是怎么搭建粗粒化模型?软件?

(PS小弟曾用materials studio搭建了一个石墨烯的粗粒化模型跟图片像是,但是导出car格式的数据没有坐标等信息)

粗粒化建模请教--如何搭建可在lammps运行的模型
石墨烯粗粒化.GIF
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chuntao118

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
Ergon: 金币+20, 有帮助 2015-07-29 11:16:42
粗粒化的思想说起来是很简单的,但是具体做起来,尤其是具体到某一种物质的时候就变得比较复杂。难点1、如何搭建好粗粒化模型,即你现在遇到的问题,通常是根据实验结果和经验或者尝试而完成的,即常说的粗粒化映射。难点2、粗粒化势函数的构造也就是我们常说的力场。这个可以说是搭建的力场在不影响模拟结果的前提下越简单越好。难点3,当有较好的力场时,我们还要考虑模型之间的信息传递,即常用的方法有MS-CG,RMC\IBM和RE等,这可以理解为势能函数的参数优化处理。然后才是利用所建粗粒模型来研究体系的性质。这里的1、2主要依赖于经验和直觉(可以利用已有文献结果)3,主要是理论分析和数学方法的选择(MS-CG,RMC\IBM和RE)。4、较为简单,就是模拟需要的结果。若借助于已有的软件可能会简单许多,前提是,有软件,会用软件。我没有用软件,所以不敢多说,但是在文献中大多都是lammps、VOTCA和gromacs。
2楼2015-02-01 09:36:48
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1205100321

新虫 (初入文坛)

您好,我正好要用MS粗粒化石墨烯,新手花了好久摸不到头绪,可以指点下我具体实操,或者发一份您模拟的石墨烯粗粒化文件到我邮箱zbr1057856363@163.com吗,感激不尽
3楼2016-12-06 21:41:44
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庄晟逸

银虫 (小有名气)

你好,请问一下楼主,怎么用MS搭建出来一个正方形的单层石墨烯呢?我搭出来的都是长方形的,想求教一下啊,谢谢你
彻底的唯物主义者是无所畏惧的!
4楼2017-07-04 17:32:04
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韩述8880

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chuntao118 at 2015-02-01 09:36:48
粗粒化的思想说起来是很简单的,但是具体做起来,尤其是具体到某一种物质的时候就变得比较复杂。难点1、如何搭建好粗粒化模型,即你现在遇到的问题,通常是根据实验结果和经验或者尝试而完成的,即常说的粗粒化映射 ...

您好 请问,MS—CG 的 导出 您做出来了吗
5楼2018-09-05 20:01:53
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lisa25496

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 韩述8880 at 2018-09-05 20:01:53
您好 请问,MS—CG 的 导出 您做出来了吗...

你好 请问MS-CG的导出现在还做出来了?
不忘初心,方得始终
6楼2020-03-19 18:17:44
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