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Ergon金虫 (著名写手)
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[求助]
粗粒化建模请教--如何搭建可在lammps运行的模型 已有1人参与
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各位大神，小弟想要做些粗粒化方面的模拟。有个论文是模拟粗粒化石墨烯的。高了好些天模型没搭建好。 想问的问题是怎么搭建粗粒化模型？软件？ （PS小弟曾用materials studio搭建了一个石墨烯的粗粒化模型跟图片像是，但是导出car格式的数据没有坐标等信息）  石墨烯粗粒化.GIF |
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chuntao118
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【答案】应助回帖
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Ergon: 金币+20, ★有帮助 2015-07-29 11:16:42
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| 粗粒化的思想说起来是很简单的，但是具体做起来，尤其是具体到某一种物质的时候就变得比较复杂。难点1、如何搭建好粗粒化模型，即你现在遇到的问题，通常是根据实验结果和经验或者尝试而完成的，即常说的粗粒化映射。难点2、粗粒化势函数的构造也就是我们常说的力场。这个可以说是搭建的力场在不影响模拟结果的前提下越简单越好。难点3，当有较好的力场时，我们还要考虑模型之间的信息传递，即常用的方法有MS-CG，RMC\IBM和RE等，这可以理解为势能函数的参数优化处理。然后才是利用所建粗粒模型来研究体系的性质。这里的1、2主要依赖于经验和直觉（可以利用已有文献结果）3，主要是理论分析和数学方法的选择(MS-CG，RMC\IBM和RE)。4、较为简单，就是模拟需要的结果。若借助于已有的软件可能会简单许多，前提是，有软件，会用软件。我没有用软件，所以不敢多说，但是在文献中大多都是lammps、VOTCA和gromacs。 |
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