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tangbaozi铁虫 (小有名气)
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计算模型坐标的导入
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各位虫友，恳请大家帮我解答这个疑问： 我看到文献里面的这个模型的坐标，于是我复制下来，粘到TXT里面，再将文档后缀换成mol，但是放入到MS 里面之后却不能得到模型。我讲TXT里面的内容粘下来了，请大家帮忙看看，新学MS，不胜感激。 Au 0.06620 0.03270 0.01460 Au 0.07490 -1.47650 -2.35720 Au 0.02820 1.49720 -2.35830 Au -2.33330 -0.04570 -1.47730 Au 2.45520 0.11950 -1.43540 Au -1.41840 -2.40620 -0.02230 Au 1.60290 -2.32610 -0.00770 Au -1.49520 2.35620 0.01940 Au 1.53750 2.53060 0.06090 Au -2.34740 -0.07090 1.47220 Au 2.44220 0.07860 1.49130 Au 0.04780 -1.53130 2.35050 Au 0.00330 1.43570 2.42090 Au 0.02610 -2.97200 -4.75160 Au -0.06540 2.96910 -4.72450 Au -4.71560 -0.14450 -2.97750 Au 4.76270 0.14380 -2.89380 Au -2.87410 -4.81730 -0.05820 Au 3.06100 -4.70460 -0.03210 Au -3.25450 4.56510 0.03810 Au -4.74790 -0.20610 2.93740 Au 4.73230 0.05630 2.98010 Au -0.02860 -3.09630 4.70450 Au -0.12740 2.84690 4.82060 Au -0.07660 -0.02550 -4.92090 Au -2.40420 -1.57080 -4.00760 Au 2.45030 -1.49850 -4.04590 Au -1.42830 -4.04530 -2.46920 Au 1.54110 -4.02070 -2.47790 Au -2.47870 1.45600 -3.99020 Au 2.34300 1.38260 -4.16590 Au -1.75170 3.89960 -2.44760 Au 1.13980 4.17240 -2.31170 Au -3.90980 -2.55850 -1.59240 Au -4.07100 2.30540 -1.55910 Au -4.89120 -0.13050 -0.01910 Au 3.92680 -2.50850 -1.80040 Au 3.61740 2.73900 -1.97230 Au 4.93160 -0.54080 0.03110 Au 0.09630 -4.90110 -0.04010 Au -3.93080 -2.58920 1.50920 Au -1.45640 -4.10370 2.38310 Au 3.91610 -2.56030 1.79900 Au 1.52260 -4.07080 2.42290 Au -0.34520 4.93360 0.08520 Au -4.08970 2.27180 1.57170 Au -1.77860 3.81910 2.53410 Au 3.59990 2.67490 2.13200 Au 1.12350 4.10310 2.46680 Au -2.45300 -1.67230 3.95560 Au -2.53180 1.35360 4.03060 Au 2.40620 -1.61390 4.05130 Au 2.29220 1.25440 4.26750 Au -0.14040 -0.15560 4.94830 S 4.37160 6.81250 0.04090 C 3.22220 8.13680 -0.49300 C 2.29530 8.65900 0.62340 H 3.86320 8.96670 -0.83800 H 2.60850 7.80380 -1.34310 C 1.11090 7.70770 0.87310 N 2.95240 8.87470 1.92410 H 1.84730 9.60890 0.27850 O 0.42800 7.25110 -0.05140 O 0.90290 7.44820 2.15660 H 1.67570 7.99860 2.58930 H 3.80820 8.29000 1.94920 H 3.21440 9.85520 2.07510 Au 3.10000 4.81980 0.11150 |
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franch: 金币+3, 谢谢回帖交流。。。 2014-10-20 19:16:24
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就是xzy格式的文件，先以txt格式把坐标复制进来，再改成*.xyz格式就成，xyz格式的最简单，不象其他格式文件有许多要求，给你看个例子 15 Al 1.936457 0.886786 0.873761 Al 0.887211 1.284802 -1.694369 Al 0.915452 -1.522130 1.851198 Al -1.886917 1.537744 -1.477159 Al -0.753197 -2.608860 -0.107145 Al -0.217533 2.628382 0.481785 Al -2.908564 -0.871268 -0.499831 Al -1.858092 -1.268364 2.067936 Al -2.562126 1.297727 1.231929 Al 1.591297 -1.281601 -0.857531 Al -0.767657 -0.883147 -2.303832 Al -0.203467 0.899693 2.678255 C -0.485865 0.008236 0.187003 O -0.216034 4.094169 -2.956409 O -0.170197 4.734041 -1.926278 |
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