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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 分子生理 » NCBI上查找基因
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幸运果28

新虫 (初入文坛)

[求助] NCBI上查找基因 已有2人参与

怎样在NCBI上查找一个基因的注册时间以及更新次数？谢谢！假如在NCBI上，我找到了关于一个物种的所有基因，能否按注册时间顺序进行排列显示出来？
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1楼 2015-01-26 16:35:37
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
{转载自lskypool}
一般上面的时间是序列提交到NCBI上面的时间

比如你搜索Escherichia coli吧

在genomes里面会出现：
1 Genome: genome sequencing projects by organism

点1进去，出现：
Reference genomes: [see all organisms]
  Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655
  Escherichia coli O157:H7 str. Sakai
  Escherichia coli IAI39
  Escherichia coli UMN026
  Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C
  Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493

点开第一个，找到RefSeq下面的NC_000913.2：
Type Name RefSeq INSDC Size (Mb) GC% Protein rRNA tRNA Other RNA Gene Pseudogene

Chr    -    NC_000913.2    U00096.2    4.64    50.8    4,145    22    89    65    4,497    181   

再进去，找到COMMENT，里面一般会说是什么时候提交的，如下：
COMMENT     REVIEWED REFSEQ: This record has been curated by NCBI staff. The
            reference sequence is identical to U00096.
            On Jun 24, 2004 this sequence version replaced gi:16127994.
赞一下(2人) 回复此楼
人生贵在行动，迟疑不决时，不妨先迈出小小一步。
3楼2015-01-26 16:51:30
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红卫大兵

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
基因的信息在不断地更新，所以你可以找到最新的一次更新的信息
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2015-01-26 16:43:14
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幸运果28

新虫 (初入文坛)
我想知道发现的第一个竹子基因是哪个？
赞一下 回复此楼
4楼2015-01-26 17:06:37
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