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新虫 (初入文坛)

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[求助] NCBI上查找基因已有2人参与

怎样在NCBI上查找一个基因的注册时间以及更新次数？谢谢！假如在NCBI上，我找到了关于一个物种的所有基因，能否按注册时间顺序进行排列显示出来？

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1楼 2015-01-26 16:35:37

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【答案】应助回帖

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{转载自lskypool}
一般上面的时间是序列提交到NCBI上面的时间

比如你搜索Escherichia coli吧

在genomes里面会出现：
1 Genome: genome sequencing projects by organism

点1进去，出现：
Reference genomes: [see all organisms]
  Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655
  Escherichia coli O157:H7 str. Sakai
  Escherichia coli IAI39
  Escherichia coli UMN026
  Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C
  Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493

点开第一个，找到RefSeq下面的NC_000913.2：
Type Name RefSeq INSDC Size (Mb) GC% Protein rRNA tRNA Other RNA Gene Pseudogene

Chr - NC_000913.2 U00096.2 4.64 50.8 4,145 22 89 65 4,497 181

再进去，找到COMMENT，里面一般会说是什么时候提交的，如下：
COMMENT    REVIEWED REFSEQ: This record has been curated by NCBI staff. The
         reference sequence is identical to U00096.
         On Jun 24, 2004 this sequence version replaced gi:16127994.