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shellyxss

金虫 (正式写手)

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[求助] Scaffold条数大小全基因组测序已有2人参与

全基因组测序的结果出来了（细菌，精细图），有太多问题了，先问一个我最捉急的问题

最后scaffold条数是1条，但是scaffold的长度和预测的基因组的大小（用K-mer统计）差了1M多，那是不是说明我的基因组有1M多是没有序列的啊？

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Always be curious about nature

1楼2015-01-05 09:46:39

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nanhu1984

银虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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shellyxss: 金币+4, ★★★很有帮助 2015-01-06 08:58:42

scaffold的长度基本上应该就是你的基因组的大小了，应该不会和真实的相差1M那么多，另外，我不知道你用K-mer统计预测的基因组大小准不准。

https://www.microbialgenomic.cn/

3楼2015-01-05 19:45:22

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