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如何分析测序结果(菜鸟求助)
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bylip
木虫
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[
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]
如何分析测序结果(菜鸟求助)
已有1人参与
在比对测序的结果和pubmed上的结果后,找到几个有意义的突变,氨基酸层面的改变。那么如何确定这些突变是致病突变呢?只有通过查阅文献吗?有没有简单快速的方法搜索到已报道的相关基因突变的文献呢?
刚接触分子不久,需要分析一些结果,谢谢各位热心的虫子。
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1楼
2015-01-04 16:03:17
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zliean
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6楼
:
Originally posted by
zliean
at 2015-01-09 01:33:19
测一个反应公司会给你发回来1000左右的碱基序列 中间的800bp是可信的
...
比对的区域在这八百bp 就是可信的
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7楼
2015-01-09 01:37:38
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zliean
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【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
先用你的序列去NCBI上比对下 可以找到相似最高的基因型的那篇文献 看看差异位点 和同源性 再两条序列翻译下 看看 氨基酸差异 差异大的话 让它表达 做生理测定 才能知道你那变异是否有意义 或者去和致病基因的碱基和氨基酸序列比对下
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2楼
2015-01-04 17:45:42
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bylip
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2楼
:
Originally posted by
zliean
at 2015-01-04 17:45:42
先用你的序列去NCBI上比对下 可以找到相似最高的基因型的那篇文献 看看差异位点 和同源性 再两条序列翻译下 看看 氨基酸差异 差异大的话 让它表达 做生理测定 才能知道你那变异是否有意义 或者去和致病基因的碱 ...
我现在已经能找到氨基酸的差异了,只是不能确定这个差异是否致病,我如何能找到有关这个基因致病变异的相关文献呢?有没有什么快速高效的方法?
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3楼
2015-01-05 08:09:37
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bylip: 金币+8,
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2015-01-06 16:30:04
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3楼
:
Originally posted by
bylip
at 2015-01-05 08:09:37
我现在已经能找到氨基酸的差异了,只是不能确定这个差异是否致病,我如何能找到有关这个基因致病变异的相关文献呢?有没有什么快速高效的方法?...
拿你那基因原本登陆号或者基因型去ncbi找吧
[ 发自小木虫客户端 ]
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4楼
2015-01-05 18:24:45
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