| 查看: 3180 | 回复: 10 | |||
fengjunchen铜虫 (小有名气)
|
[交流]
想学习Amber进行动力学模拟，怎么入门？ 已有9人参与
|
|
本来应该是求助帖……不混论坛没金币发布出来。 本人刚刚入学，做实验的基本不太会信息学的东西，导师给的方向需要动力学模拟，关注酶活和蛋白的热稳定性。 询问学院里信息学的老师，向我推荐了Amber。稍微搜了搜感觉各种看不明白，主要有一下几个问题： 1、Amber主页上有两个软件，Amber14和AmberTools14，前者收费，后者可以直接下载；那么，可以只使用后者计算吗？Amber14是否必须，因为我知道倒是绝对不会出钱买的……Amber14能否或者怎样申请免费？ 2、个人之前没用过linux，Amber是否能在Windows下运行？否则熟悉linux又是个挺麻烦的事儿。当然，从下载的bz2的文件看来好像windows可能性不大唉…… 3、看了一些网上的帖子，好像还需要安很多东西，还有设置什么变量……还看到了各种装不上的求助帖。是否真那么费劲？ 4、最后嘛，就是厚颜无耻求教程了~~一定要0基础的啊，不然肯定看不懂。 求各位前辈能给些帮助~~ |
回复此楼» 猜你喜欢
导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！
已经有7人回复
-
青基如何破局
已经有7人回复
-
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有17人回复
-
基金不中，共勉
已经有10人回复
-
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有11人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有7人回复
-
基金未中，这种答复是模板吗？
已经有6人回复
-
看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉……
已经有6人回复
-
怎么看青基中了没有啊
已经有5人回复
-
梦想
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- amber跑动力学，晶体结构中的水能不能用限制力固定住
已经有8人回复
- 最近在学习分子动力学模拟，不知道castep跑分子动力学效果如何呢？
已经有12人回复
- Vasp相比经典分子动力学的优缺点
已经有11人回复
- 用amber制作小分子力场参数时突然遇到的一些问题
已经有12人回复
- Amber 分子动力学 求助！！！！
已经有10人回复
- 选择学习charmm还是amber呢？
已经有10人回复
- LAMMPS分子动力学模拟学习用书推荐
已经有6人回复
- 求amber 10 或 amber 11软件
已经有6人回复
- 几个学习第一性原理动力学的重要网址
已经有3人回复
- 活性中心含双铜的蛋白酶的分子动力学模拟（Amber）
已经有6人回复
- amber跑蛋白复合物动力学前，小分子用高斯如何处理
已经有7人回复
- 使用Amber进行QM/MM动力学模拟
已经有5人回复
- 关于amber动力学模拟中MM/GBSA的问题
已经有7人回复
- 有没有人用Amber做过膜蛋白动力学模拟
已经有14人回复
- 搞机器人方面理论分析，包括动力学建模、控制算法设计，最需要学习哪些数学方面的知识
已经有15人回复
- 【求助】amber功能探讨
已经有9人回复
2楼2014-12-25 13:03:50
3楼2014-12-25 21:05:39
houxuben
木虫 (正式写手)
MEDCHEM03
- 应助: 50 (小学生)
- 金币: 3723.7
- 散金: 32
- 红花: 5
- 帖子: 750
- 在线: 476.5小时
- 虫号: 918214
- 注册: 2009-12-02
- 性别: GG
- 专业: 药物化学
4楼2014-12-26 08:10:13
fanc232
新虫 (小有名气)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 1238.4
- 散金: 206
- 红花: 3
- 帖子: 253
- 在线: 108.7小时
- 虫号: 1046781
- 注册: 2010-06-24
- 性别: MM
- 专业: 细胞生物学研究中的新方法
5楼2014-12-26 09:08:22
qiulinqiong
禁虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
本帖内容被屏蔽 |
6楼2014-12-26 19:01:14
 |
7楼2014-12-26 19:31:43
fengjunchen
铜虫 (小有名气)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 745.1
- 红花: 2
- 帖子: 136
- 在线: 77.2小时
- 虫号: 3548432
- 注册: 2014-11-20
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
8楼2015-03-27 13:49:37
9楼2016-01-21 17:13:25
|
|
10楼2016-08-11 22:20:03
