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fengjunchen铜虫 (小有名气)
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[交流]
想学习Amber进行动力学模拟,怎么入门? 已有9人参与
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本来应该是求助帖……不混论坛没金币发布出来。 本人刚刚入学,做实验的基本不太会信息学的东西,导师给的方向需要动力学模拟,关注酶活和蛋白的热稳定性。 询问学院里信息学的老师,向我推荐了Amber。稍微搜了搜感觉各种看不明白,主要有一下几个问题: 1、Amber主页上有两个软件,Amber14和AmberTools14,前者收费,后者可以直接下载;那么,可以只使用后者计算吗?Amber14是否必须,因为我知道倒是绝对不会出钱买的……Amber14能否或者怎样申请免费? 2、个人之前没用过linux,Amber是否能在Windows下运行?否则熟悉linux又是个挺麻烦的事儿。当然,从下载的bz2的文件看来好像windows可能性不大唉…… 3、看了一些网上的帖子,好像还需要安很多东西,还有设置什么变量……还看到了各种装不上的求助帖。是否真那么费劲? 4、最后嘛,就是厚颜无耻求教程了~~一定要0基础的啊,不然肯定看不懂。 求各位前辈能给些帮助~~ |
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