| 查看: 6190 | 回复: 11 | ||||
pinwei2014铜虫 (初入文坛)
|
[交流]
Vasp相比经典分子动力学的优缺点 已有4人参与
|
|||
| 刚接触分子动力学，一直有个疑惑，既然Vasp是基于量子力学的分子动力学模拟，那它是不是完胜了经典的分子动力学？ |
回复此楼» 猜你喜欢
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有17人回复
-
面上合作单位盖章
已经有5人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有8人回复
-
导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！
已经有7人回复
-
申请删除本帖
已经有7人回复
-
基金不中，共勉
已经有10人回复
-
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有11人回复
-
基金未中，这种答复是模板吗？
已经有6人回复
-
看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉……
已经有6人回复
-
怎么看青基中了没有啊
已经有5人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- VASP做分子动力学模拟的时候，CONTCAR文件能不能删除掉修正的部分直接使用？
已经有3人回复
- 第一原理动力学的系综选择，和各种系综的输入文件Example
已经有13人回复
- VASP分子动力学优化的INCAR如下，怎么CONTCAR和POSCAR没有什么变化啊？
已经有13人回复
- 【求助】VASP做分子动力学模拟NVT系综下为啥内能竟然是升高的？
已经有8人回复
- 【任务征集】VASP跑分子动力学数据处理方法
已经有20人回复
- 【其他】关于MS和VASP的比较
已经有6人回复
- 【求助】VASP里的几个能量怎么区别呢？？？？？？？？
已经有23人回复
- 【求助】请教分子动力学模拟软件选择
已经有11人回复
- 【活动】vasp计算分子动力学讨论合集及专贴（筹划中）
已经有33人回复
- 【求助】关于vasp进行分子动力学模拟的求助
已经有12人回复
- 【求助】Abinit, Pwscf 软件选择问题
已经有15人回复
- 【求助】请教vasp计算恒温第一原理分子动力学
已经有9人回复
- 【转帖】VASP和ABINIT优缺点比较
已经有18人回复
- 【求助】请教分子动力学模拟
已经有8人回复
- 【求助】vasp分子动力学模拟求助
已经有15人回复
- 【求助】请问哪种方法的模拟结果更加可信？
已经有8人回复
- 【原创】vasp的分子动力学模拟
已经有44人回复
卡开发发
专家顾问 (著名写手)
Ab Initio Amateur
-
专家经验: +224 - 1ST强帖: 2
- 应助: 47 (小学生)
- 金币: 3567.8
- 散金: 14
- 红花: 223
- 帖子: 2477
- 在线: 1254小时
- 虫号: 1369423
- 注册: 2011-08-16
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
- 管辖: 第一性原理
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
经典动力学根本不涉及电子，只是分子骨架的运动。原子间的作用分为两种，键力和非键力。前者根据胡克定律（目前可能不少力场也考虑非简谐项，比如x^3项）定义，把分子拆分成键长振动、键角振动、二面角变化导致的能量变化，不同力场中的不同类型的键、不同原子间的键他们的劲度系数都不同，通过一组经验化的值来描述；后者则是拟合LJ曲线，来描述vdW和静电力。所以绝大多数情况不适合描述成键、断键的过程（反应力场除外），严重牵涉到电子效应的时候肯定解决不了问题。 从头算动力学就要分为CP、BO以及其他的动力学，BOMD和上述经典力学大致操作差不多，但是在计算分子的能量时（此时分子内、分子间的作用都是计算的），每一步产生的构型不是通过力场，而是严格的求解K-S方程，每一步都类似计算单点能那样需要进行scf。计算量可想而知，这样成键、断键就可以描述。但是由于DFT的一些特性，弱作用处理起来不是那么好，好的方法代价又太大，对于那些弱作用主导的大体系（蛋白、胰岛素），经典动力学还是很有必要的。 所以，除了计算每个构形的能量处理可能不一样，对于原子核的处理没什么太大不同，所以那些MSD等性质仍然可以计算，然而一些和电子尺度相关的性质，经典动力学就无能为力了。BOMD建议先做单点能测试看看每个构形计算的时间大概多少，MD准备做多少个step（还需检验平衡），大致乘一下就可以估计计算时间及可行性了。 一点个人观点，望其他老前辈批评指正了。。。 |
7楼2014-04-03 09:36:29
飞行鸟
至尊木虫 (文坛精英)
- 应助: 2135 (讲师)
- 金币: 22804.4
- 散金: 5054
- 红花: 377
- 沙发: 6
- 帖子: 16032
- 在线: 1486.8小时
- 虫号: 638457
- 注册: 2008-10-27
- 专业: 宇宙学
4楼2014-04-02 15:04:55
飞行鸟
至尊木虫 (文坛精英)
- 应助: 2135 (讲师)
- 金币: 22804.4
- 散金: 5054
- 红花: 377
- 沙发: 6
- 帖子: 16032
- 在线: 1486.8小时
- 虫号: 638457
- 注册: 2008-10-27
- 专业: 宇宙学
2楼2014-04-02 12:26:18
pinwei2014
铜虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 85.3
- 帖子: 30
- 在线: 17.3小时
- 虫号: 2970810
- 注册: 2014-02-16
- 专业: 金属材料表面科学与工程
3楼2014-04-02 14:17:35
pinwei2014
铜虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 85.3
- 帖子: 30
- 在线: 17.3小时
- 虫号: 2970810
- 注册: 2014-02-16
- 专业: 金属材料表面科学与工程
5楼2014-04-02 15:42:26
stractor
金虫 (著名写手)
- 1ST强帖: 6
- 应助: 91 (初中生)
- 金币: 1487.6
- 散金: 666
- 红花: 30
- 沙发: 1
- 帖子: 2224
- 在线: 426.8小时
- 虫号: 394087
- 注册: 2007-06-06
- 专业: 半导体材料
6楼2014-04-02 23:03:06
pinwei2014
铜虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 85.3
- 帖子: 30
- 在线: 17.3小时
- 虫号: 2970810
- 注册: 2014-02-16
- 专业: 金属材料表面科学与工程
8楼2014-04-24 13:37:54
pinwei2014
铜虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 85.3
- 帖子: 30
- 在线: 17.3小时
- 虫号: 2970810
- 注册: 2014-02-16
- 专业: 金属材料表面科学与工程
9楼2014-04-24 14:05:09
stractor
金虫 (著名写手)
- 1ST强帖: 6
- 应助: 91 (初中生)
- 金币: 1487.6
- 散金: 666
- 红花: 30
- 沙发: 1
- 帖子: 2224
- 在线: 426.8小时
- 虫号: 394087
- 注册: 2007-06-06
- 专业: 半导体材料
10楼2014-04-24 15:07:44
