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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】VASP做分子动力学模拟NVT系综下为啥内能竟然是升高的？
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xiaoxiao6726

银虫 (初入文坛)

[求助] 【求助】VASP做分子动力学模拟NVT系综下为啥内能竟然是升高的？

很奇怪，在用VASP做分子动力学模拟时，同样的INCAR设置下有些体系内能是降低的，有些体系竟然是升高的，如图所示，请教各位高手这可能是什么原因造成的？非常感谢！
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爱生活爱宝宝
1楼 2011-08-01 09:08:50
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

【答案】应助回帖

★ ★
uuv2010(金币+2): 欢迎参加交流 2011-08-01 12:09:34
xiaoxiao6726(金币+10): 多谢啦，还想请教一个问题，在什么样的误差范围内可以认为内能的变化是可以接受的呢？ 2011-08-01 15:02:27
正常，主要是由于计算误差导致的。   
改善的办法是减小MD的步长。
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真理是一点点接近的！
2楼2011-08-01 10:13:03
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Gina88

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gavinliu7390 at 2011-08-01 10:13:03:
正常，主要是由于计算误差导致的。   
改善的办法是减小MD的步长。

请问大侠，分子动力学的时候出现以下警告怎么办啊？

Successfully completed.

Resource usage summary:

    CPU time   :16096231.00 sec.
    Max Memory :     22146 MB
    Max Swap   :     25954 MB

    Max Processes  :        46
    Max Threads    :        79

The output (if any) follows:

running on   32 nodes
distr:  one band on    1 nodes,   32 groups
vasp.5.2.2 15Apr09 complex
POSCAR found :  1 types and   74 ions
LDA part: xc-table for Ceperly-Alder, Vosko type interpolation para-ferro

-----------------------------------------------------------------------------
|                                                                             |
|           W    W    AA    RRRRR   N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|           W    W   A  A   R    R  NN   N  II  NN   N  G    G  !!!           |
|           W    W  A    A  R    R  N N  N  II  N N  N  G       !!!           |
|           W WW W  AAAAAA  RRRRR   N  N N  II  N  N N  G  GGG   !            |
|           WW  WW  A    A  R   R   N   NN  II  N   NN  G    G                |
|           W    W  A    A  R    R  N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|                                                                             |
|      VASP found    219 degrees of freedom                                   |
|      the temperature will equal 2*E(kin)/ (degrees of freedom)              |
|      this differs from previous releases, where T was 2*E(kin)/(3 NIONS).   |
|      The new definition is more consistent                                  |
|                                                                             |
-----------------------------------------------------------------------------

POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
FFT: planning ...(            1 )
reading WAVECAR
prediction of wavefunctions initialized - no I/O
entering main loop
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
RMM:   1     0.258916673329E+04    0.25892E+04   -0.47678E+04   768   0.587E+02
RMM:   2     0.830026842535E+03   -0.17591E+04   -0.20517E+04   768   0.134E+02
RMM:   3     0.239121326438E+03   -0.59091E+03   -0.94025E+03   768   0.957E+01
RMM:   4    -0.155929959519E+03   -0.39505E+03   -0.39046E+03   768   0.775E+01
RMM:   5    -0.280110078607E+03   -0.12418E+03   -0.11962E+03   768   0.478E+01
RMM:   6    -0.329937330070E+03   -0.49827E+02   -0.41162E+02   768   0.299E+01
RMM:   7    -0.348843301236E+03   -0.18906E+02   -0.16211E+02   768   0.185E+01
RMM:   8    -0.357263286004E+03   -0.84200E+01   -0.71033E+01   768   0.125E+01
RMM:   9    -0.364251388673E+03   -0.69881E+01   -0.66987E+01  1946   0.831E+00
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3楼2011-08-01 10:44:00
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

【答案】应助回帖

★ ★
franch(金币+2): 谢谢回帖交流 2011-08-01 21:30:28
引用回帖:
3楼: Originally posted by Gina88 at 2011-08-01 10:44:00:
请问大侠，分子动力学的时候出现以下警告怎么办啊？

Successfully completed.

Resource usage summary:

    CPU time   :16096231.00 sec.
    Max Memory :     22146 MB
    Max Swap   :     2595 ...

可以忽略，不用管它。
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真理是一点点接近的！
4楼2011-08-01 14:35:56
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enola

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
1楼: Originally posted by xiaoxiao6726 at 2011-08-01 09:08:50:
很奇怪，在用VASP做分子动力学模拟时，同样的INCAR设置下有些体系内能是降低的，有些体系竟然是升高的，如图所示，请教各位高手这可能是什么原因造成的？非常感谢！

xiaoxiao6726，你好，请问你在做NVT模拟时，怎么样来设置热浴呢？使用smear>0吗？
谢谢
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timeflies..
5楼2011-08-03 16:20:34
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xiaoxiao6726

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by enola at 2011-08-03 16:20:34:
xiaoxiao6726，你好，请问你在做NVT模拟时，怎么样来设置热浴呢？使用smear>0吗？
谢谢

SMASS=0就可以吧，你可以看OUTCAR文件，它会自动计算并设置成一个合适的值。
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

10133202
爱生活爱宝宝
6楼2011-08-04 11:23:44
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enola

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by xiaoxiao6726 at 2011-08-04 11:23:44:
SMASS=0就可以吧，你可以看OUTCAR文件，它会自动计算并设置成一个合适的值。

好的，谢谢你阿。。。我去试试看
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timeflies..
7楼2011-08-05 08:47:08
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凌云志123

金虫 (正式写手)
你好，请问你的内能一直升高的问题解决了吗？我也遇到同样的问题
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8楼2015-11-27 15:45:06
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10133202

铁虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by xiaoxiao6726 at 2011-08-04 11:23:44
SMASS=0就可以吧，你可以看OUTCAR文件，它会自动计算并设置成一个合适的值。...

xiaoxiao您好，请问在outcar文件里怎么看smass优化的结果呢？您说的意思是这样吗：假定模拟NVT系综，SMASS设定大于等于零的任意一个值，然后OUTCAR中会将SMASS的合理的值给出来吗？那怎么看呢？能否具体讲解下？谢谢亲。
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9楼2018-12-08 13:15:56
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