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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 求助：已知蛋白的名称和序列，怎么知道它的功能？
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牛焕杰

银虫 (小有名气)

[求助] 求助：已知蛋白的名称和序列，怎么知道它的功能？ 已有3人参与

已知蛋白的名称和序列，怎么知道它的功能？或者说怎么查它是否与抑菌活性相关？我的蛋白是从枯草芽孢杆菌的发酵液里提取出来的
比较着急，非常希望大神可以帮助，十分感谢
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1楼 2014-12-22 16:30:41
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xiaoyugutou

捐助贵宾 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
add this protein into the culture and compare the growth curve with that of without this protein ?
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3楼2014-12-23 00:23:13
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superior111

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
牛焕杰: 金币+10, ★有帮助 2014-12-30 09:40:29
在NCBI里进行blastp比对，看与它相似度高的相关蛋白基因，上面都有相关的功能注释，可以大致知道其可能功能的！

[ 发自小木虫客户端 ]
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Mol是分子生物学molecularbiology前三个字母，EPI=EmuchProfessionalIndex，即小木虫专家指数，MolEPI也就是小木虫分子生物版专家指数。
2楼2014-12-22 23:07:46
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barbara2097

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我当时是以NCBI为主
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/acc ... ih.gov%2Fgene%2F966

然后对于少数蛋白数据库未及时更新的，用BioGPS和GeneCards做辅助检索，偶尔也用了一下RefGene，看个人需要吧
BioGPS：
http://biogps.org/#goto=welcome
GeneCards：
http://www.genecards.org/
RefGene：
http://refgene.com/
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4楼2014-12-23 09:07:20
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