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kobe6777新虫 (小有名气)
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CI-NEB过渡态搜索脚本应用及处理问题
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我用CI-NEB搜索到过渡态后用nebresults.pl脚本处理数据，生成一些列文件，在neb.dat中的数据都表示什么意思啊？ 0 0.000000 0.000000 0.000000 0 1 1.360466 0.000674 -0.067762 1 2 2.719057 2.251713 0.000777 2 3 3.440332 0.005108 1.945967 3 4 4.161964 -0.380791 0.019030 4 5 4.884291 -0.385686 0.000000 5 1、第二例是image间的距离，他这个具体是怎么计算的啊？ 2、第三列是能垒，第四列是每个imag收到的力，这个力指的是什么力？怎么判断他们符不符合标准啊？希望能说的具体点！我看他们对应着输出文件里的这个NEB: projections on to tangent (spring, REAL) -3.186584 0.000777 REAl的这个值 还有在nebef.dat中 0 0.000000 -38.792300 0.000000 1 0.009502 -38.791600 0.000700 2 0.009501 -36.540500 2.251800 3 0.004749 -38.787100 0.005200 4 0.007105 -39.173000 -0.380700 5 0.000000 -39.177900 -0.385600 第四列所表示的受力指的是什么力啊？我在OUTCAR中没有找到相应的数值。。。 怎么判断算的过渡态和其他的点在不在同一个势能曲面上啊？ 希望高手能指点指点！ |
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