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liupeitao20

金虫 (小有名气)

[求助] CL_NEB方法搜索过渡态 怎么准确获得saddle-point 的几何及相应的振动频率？

我们知道 用CL_NEB计算能垒的或者搜索过渡态的时候，先优化好初始态和终了态，然后做插值获得几个Images，然后ISIF=2 等相应设置后计算，收敛后得到能量，即获得能垒，可是想准确得到鞍点处过渡态的几何结构，如何获得？我是这么做的， 对于能量最高的Image的CONTACR拷贝至POSCAR然后以力作为收敛标准，进行优化，优化收敛后进行频率计算，获得该处的频率只有一个虚频，即找到了该过渡态？不知我做的是否正确，还请牛人指点？因为我得到过渡态的结构的频率虚频不止一个，所以我很怀疑自己的方法！还有就是大家怎么去算一个体系的振动频率！是直接用VASP自带的还是自己编程构造dynamical matrix然后求解频率？
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1楼 2012-09-24 13:56:13
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hakuna

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2012-09-25 09:52:44
liupeitao20: 金币+5, ★★★很有帮助, 说的很有道理 2012-09-26 20:34:52
CNEB收敛后，择能量最高的image，不要优化，算频率，如果有且仅有一个虚频，其振动模式沿断键或成键方向可是为TS，若有多个虚频，把不需要的虚频消掉即可，消虚频方法各人可能有不同做法.....
至于怎么算频率，查下IBRION......
几何结构吗，不就在OUTCAR里吗？
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2楼2012-09-25 06:41:46
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liupeitao20

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hakuna at 2012-09-25 06:41:46
CNEB收敛后，择能量最高的image，不要优化，算频率，如果有且仅有一个虚频，其振动模式沿断键或成键方向可是为TS，若有多个虚频，把不需要的虚频消掉即可，消虚频方法各人可能有不同做法.....
至于怎么算频率，查下 ...

谢谢回复！能量最高点处如有多个虚频，只能说是为完全达到过渡态，为什么要去人为的消除虚频！频率计算VASP自带的本人熟悉，想问一下有没有更好的code可以自己构造动力学矩阵，然后求解频率！
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3楼2012-09-25 20:04:55
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SeanMa2010

铜虫 (初入文坛)
★
WDD880227: 金币+1, 谢谢参与 2012-09-26 16:36:25
能量最高的Image不能优化啊，本来就是在saddle point附近，是非常不稳定的，稍一优化直接优化到某个能量极小点了，
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4楼2012-09-25 20:22:11
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hakuna

木虫 (知名作家)
★
WDD880227: 金币+1, 多谢耐心指教 2012-09-26 16:36:34
引用回帖:
3楼: Originally posted by liupeitao20 at 2012-09-25 20:04:55
谢谢回复！能量最高点处如有多个虚频，只能说是为完全达到过渡态，为什么要去人为的消除虚频！频率计算VASP自带的本人熟悉，想问一下有没有更好的code可以自己构造动力学矩阵，然后求解频率！...

多个虚频意味着高阶鞍点，并不是过渡态，过渡态应该只有一个虚频且其振动模式与成键或断键模式匹配....
构造力矩阵的code没用过....
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5楼2012-09-26 09:15:44
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zhangfan2192

金虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hakuna at 2012-09-25 06:41:46
CNEB收敛后，择能量最高的image，不要优化，算频率，如果有且仅有一个虚频，其振动模式沿断键或成键方向可是为TS，若有多个虚频，把不需要的虚频消掉即可，消虚频方法各人可能有不同做法.....
至于怎么算频率，查下 ...

借此地问下，vasp算的过渡态可以消虚频吗？具体怎么处理？
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相逢是缘！
6楼2012-09-29 08:57:59
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