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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 本地blast如何进行短序列比对
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laigt4769

新虫 (小有名气)

[交流] 本地blast如何进行短序列比对 已有4人参与

我在做本地blast时，发现二十几bp的序列无法进行比对，这是为什么呢，请高手指点啊！！！！
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1楼 2014-12-05 22:24:28
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)
用DNAman

[ 发自小木虫客户端 ]
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2楼2014-12-05 22:35:38
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laigt4769

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yuguiyan at 2014-12-05 22:35:38
用DNAman

比对的数据库太大了，不方便，而且比对结果没有blast详细。
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3楼2014-12-06 10:44:01
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yuehedou

木虫 (小有名气)
★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-12-06 21:19:47
用blastn-short
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每天都为自己的无知而羞耻！
4楼2014-12-06 20:16:48
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zuifenghou

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yuehedou at 2014-12-06 20:16:48
用blastn-short

怎么写命令呢？
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5楼2017-12-17 23:25:31
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王平阳

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
将value值设置成最大，比如1或者10，这样即使20bp左右的引物也是可以做BLAST的
赞一下 回复此楼
没有做不到，只有想不到！
6楼2017-12-18 14:50:02
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