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laigt4769

新虫 (小有名气)

[交流] 本地blast如何进行短序列比对 已有4人参与

我在做本地blast时,发现二十几bp的序列无法进行比对,这是为什么呢,请高手指点啊!!!!
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

用DNAman

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-12-05 22:35:38
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laigt4769

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yuguiyan at 2014-12-05 22:35:38
用DNAman

比对的数据库太大了,不方便,而且比对结果没有blast详细。
3楼2014-12-06 10:44:01
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yuehedou

木虫 (小有名气)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-12-06 21:19:47
用blastn-short
每天都为自己的无知而羞耻!
4楼2014-12-06 20:16:48
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zuifenghou

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yuehedou at 2014-12-06 20:16:48
用blastn-short

怎么写命令呢?
5楼2017-12-17 23:25:31
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王平阳

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
将value值设置成最大,比如1或者10,这样即使20bp左右的引物也是可以做BLAST的
没有做不到,只有想不到!
6楼2017-12-18 14:50:02
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