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分离一种菌株16srDNA测序列与已知菌株序列相似度在99%以上，该分离菌株算新菌株吗 已有1人参与
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RT，分离出的一种不知名的菌株经16s rDNA排列检测其序列与现有已知菌株序列相似度在99%以上，请问，该分离菌株算新菌株吗？或者该不知名菌株该怎么分类 我是生物小白  |
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 植物病原细菌学 |
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7楼2014-11-20 08:56:07
zhaozhibozhi
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Whereas isolates that have less than 97% rRNA gene-sequence similarity usually share <70% DDH and belong to different species, isolates that have ≥97% identity might or might not meet the 70% DDH criterion for inclusion in the same species. ——引自“Re-evaluating prokaryotic species” （Nature reviews Microbiology, 2005). 意思是说16S相似度小于97%，应该是不同种；大于等于97%可能是一个种，也可能不是。 你这大于99%，有很大几率不是新种。如果想明确其分类地位，还需要其它方面的证据。 |
2楼2014-11-19 13:04:53
3楼2014-11-19 13:31:29
zhaozhibozhi
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4楼2014-11-19 13:40:46