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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » DNA重组 » 测序回来的片段比模板少了两个碱基，但是翻译成蛋白质反而多了三个氨基酸，求解！
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ggyy0911

铁虫 (正式写手)

[求助] 测序回来的片段比模板少了两个碱基，但是翻译成蛋白质反而多了三个氨基酸，求解！ 已有2人参与

我自己的片段是2345个，包括起始和终止密码子。模板片段2347个碱基，我少的两个是故意截掉的。
  然后中间1000多碱基的时候一个C突变成了T，这样就导致我翻译出来的氨基酸序列居然多了三个！
  不懂。
  两个序列都不能被3整除。
  是系统无法翻译所以给了3个备选项吗？
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1楼 2014-10-30 10:40:49
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xiaomao225

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-10-30 14:38:14
虽然我研一，不懂具体实验的东西，但接触过类似的理论问题，个人感觉可能是开放阅读框架里个别基因的overlap问题，导致了阅读框的移位，我也不知道对不对。

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3楼2014-10-30 12:32:54
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hongqifei

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-10-31 23:15:27
从你的描述来看，你的序列可能是cDNA序列，里面除了包含编码区（CDS），还有5'和3' UTR区。本来这个cDNA里面应该只含有一个大的ORF。可能1000多位置的突变刚好造成了一个终止密码子，破坏了这个大的ORF，使之提前终止了。然后在后面的序列里面又有同框的ATG和终止密码子，形成了另外两个小的ORF。
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何须剑道争锋？千人指，万人封，可问江湖鼎峰，三尺秋水尘不染，天下无双。
4楼2014-10-30 16:15:53
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ggyy0911

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaomao225 at 2014-10-30 12:32:54
虽然我研一，不懂具体实验的东西，但接触过类似的理论问题，个人感觉可能是开放阅读框架里个别基因的overlap问题，导致了阅读框的移位，我也不知道对不对。

我的阅读框确实移位了……不过我也不懂具体原理，移位或者你说的overlap为什么会多翻译氨基酸？

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5楼2014-10-31 10:52:13
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