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ggyy0911

铁虫 (正式写手)

[求助] 测序回来的片段比模板少了两个碱基,但是翻译成蛋白质反而多了三个氨基酸,求解! 已有2人参与

我自己的片段是2345个,包括起始和终止密码子。模板片段2347个碱基,我少的两个是故意截掉的。
  然后中间1000多碱基的时候一个C突变成了T,这样就导致我翻译出来的氨基酸序列居然多了三个!
  不懂。
  两个序列都不能被3整除。
  是系统无法翻译所以给了3个备选项吗?
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hongqifei

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-10-31 23:15:27
从你的描述来看,你的序列可能是cDNA序列,里面除了包含编码区(CDS),还有5'和3' UTR区。本来这个cDNA里面应该只含有一个大的ORF。可能1000多位置的突变刚好造成了一个终止密码子,破坏了这个大的ORF,使之提前终止了。然后在后面的序列里面又有同框的ATG和终止密码子,形成了另外两个小的ORF。
何须剑道争锋?千人指,万人封,可问江湖鼎峰,三尺秋水尘不染,天下无双。
4楼2014-10-30 16:15:53
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xiaomao225

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2014-10-30 14:38:14
虽然我研一,不懂具体实验的东西,但接触过类似的理论问题,个人感觉可能是开放阅读框架里个别基因的overlap问题,导致了阅读框的移位,我也不知道对不对。

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-10-30 12:32:54
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ggyy0911

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaomao225 at 2014-10-30 12:32:54
虽然我研一,不懂具体实验的东西,但接触过类似的理论问题,个人感觉可能是开放阅读框架里个别基因的overlap问题,导致了阅读框的移位,我也不知道对不对。

我的阅读框确实移位了……不过我也不懂具体原理,移位或者你说的overlap为什么会多翻译氨基酸?

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2014-10-31 10:52:13
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