| 查看: 1804 | 回复: 7 | ||||
[求助]
新手求助，需要用autodock做分子模拟、对接，求文件前期准备操作及资源 已有1人参与
|
| 需要用autodock模拟大分子构象，以及与小分子的对接，但是在准备文件过程中，有一个prodrg2 server 难住我了，不知道这是什么，也不知道从哪弄来，还有PDB伤下载来的大分子PDB文件，我用写字板打开的，很多很多字，但不像乱码，不知道能不能用，也不知道该先怎么处理，现在是一片浆糊啊，求大神 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 仿真建模与计算 | 分子对接 |
» 猜你喜欢
调剂
已经有12人回复
-
求调剂 材料与工程 324分 专硕
已经有13人回复
-
化学工程与技术324调剂
已经有18人回复
-
材料085601调剂
已经有9人回复
-
一志愿西北工业大学289 085602
已经有13人回复
-
291 求调剂
已经有13人回复
-
生物与医药273求调剂
已经有19人回复
-
生物与医药调剂
已经有5人回复
-
08600生物与医药-327
已经有10人回复
-
085601初试330分找调剂
已经有10人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 在做AUTODOCK对接的时候，如何在图上像是蛋白质的残基及序号呢？
已经有3人回复
- autodock柔性对接缺少MAP文件相关问题
已经有8人回复
- autodock对接的氢键
已经有7人回复
- autodock柔性对接
已经有5人回复
- Autodock对接构象准确性的评价——RMSD
已经有10人回复
- autodock对接时蛋白的处理问题
已经有6人回复
- Autodock最后一步进行不了，在线急等啊
已经有6人回复
- Autodock中受体的准备
已经有14人回复
- 求助AUTODOCK中怎么移动分子
已经有4人回复
- Autodock的操作流程---win下
已经有565人回复
- 使用autodock4.2处理分子对接问题，在run autogrid时总是出错，请各位高人指点啊？？
已经有10人回复
- AUTODOCK对接步骤求助(附图）
已经有7人回复
- 用AutoDock对接的结合能较小，可能是什么原因？
已经有7人回复
- 用AutoDock作分子对接前的小分子能量最小化问题
已经有6人回复
- Autodock对接构象有问题，请教
已经有7人回复
- 【求助】Autodock用于虚拟筛选
已经有21人回复
- 【求助】求助：怎样将Autodock做出来的对接图保存成pdb格式？谢谢
已经有12人回复
- 【求助】autodock对接后小分子被打断的情况
已经有6人回复
- 【求助】能够计算结合自由能的分子对接软件除了autodock还有哪些？
已经有7人回复
916756502
新虫 (初入文坛)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 177.5
- 帖子: 20
- 在线: 5.7小时
- 虫号: 3427573
- 注册: 2014-09-19
- 专业: 化学生物学与生物有机化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
木头珊瑚: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-10-30 04:42:19
感谢参与，应助指数 +1
木头珊瑚: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-10-30 04:42:19
| 我也是新手，你去下载个Ultraedit吧，看pdb和psf挺好的。我觉得你做对接看中文AUTODOCK就很好，我把文件传给你，你看看吧，我做的糖和蛋白质的，结果挺好的，倒是没看到过你说的那个文件。 |
» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : AutoDock&ADT教程.7z
2014-10-29 10:06:51, 6.43 M
2楼2014-10-29 10:05:53
3楼2014-10-30 00:23:31
| 附上教程 对着教程搞就好了！ |
» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : autodocktutorial2.pdf
2014-10-30 11:09:51, 1.36 M
4楼2014-10-30 11:10:19
|
顶 [ 发自小木虫客户端 ] |
5楼2014-11-02 09:59:46
autodockytu 
捐助贵宾 (小有名气)
- 应助: 46 (小学生)
- 金币: 163.8
- 散金: 1021
- 红花: 5
- 帖子: 201
- 在线: 39.1小时
- 虫号: 1792292
- 注册: 2012-05-03
- 性别: GG
- 专业: 兽医学
6楼2014-11-05 21:54:17
7楼2015-02-22 14:56:14
蓝洋飘雪
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2455.2
- 散金: 14
- 红花: 3
- 帖子: 230
- 在线: 41.3小时
- 虫号: 3581025
- 注册: 2014-12-07
- 性别: MM
- 专业: 兽医药理学与毒理学
8楼2015-09-02 21:15:46
