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木头珊瑚

新虫 (初入文坛)

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[求助] 新手求助，需要用autodock做分子模拟、对接，求文件前期准备操作及资源已有1人参与

需要用autodock模拟大分子构象，以及与小分子的对接，但是在准备文件过程中，有一个prodrg2 server 难住我了，不知道这是什么，也不知道从哪弄来，还有PDB伤下载来的大分子PDB文件，我用写字板打开的，很多很多字，但不像乱码，不知道能不能用，也不知道该先怎么处理，现在是一片浆糊啊，求大神

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1楼 2014-10-29 05:42:29

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蓝洋飘雪

木虫 (小有名气)

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引用回帖:

2楼: Originally posted by 916756502 at 2014-10-29 10:05:53
我也是新手，你去下载个Ultraedit吧，看pdb和psf挺好的。我觉得你做对接看中文AUTODOCK就很好，我把文件传给你，你看看吧，我做的糖和蛋白质的，结果挺好的，倒是没看到过你说的那个文件。

我在做autodock时出现了问题，您能否帮我解答一下？