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小鑫166

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[求助] 新手，求同源建模详细操作步骤，谢谢已有4人参与

要做一个三聚体的蛋白，在pdb下到了单个的结构，利用 DS 3.0 如何建模？以及建模后如何检测所建模型的合理性？谢谢大家

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1楼 2014-10-21 09:38:05

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autodockytu

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【答案】应助回帖

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小鑫166: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-01-04 13:51:01

SWISS-MODEL简单，可以直接提交序列，然后获得pdb

2楼2014-10-28 22:16:09

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吴丰旭

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【答案】应助回帖

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小鑫166: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-01-04 13:50:52

本人也是新学这个教程里讲的就是同源模建比较详细我是按着这个一步步做的可以做成你可以试试！

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2014-10-31 11:31:50, 4.35 M

3楼2014-10-31 11:31:58

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monsoncupid

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小鑫166: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-01-04 13:50:42

大家回复的好像都是单个蛋白分子Homology建模，你这种情况应该算是蛋白聚集预测吧，如附图所示，里面有相应的打分，不知道3.0有没有，这个是DS4.0截的图

新手，求同源建模详细操作步骤，谢谢

AggregationPredict.png

宅若久时天然呆，呆到深处自然萌

4楼2014-11-19 12:34:53

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pymol

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小鑫166: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-01-04 13:50:29

Easymodeller也可以

赞一下(1人)

5楼2014-11-24 09:29:53

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