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soutree

木虫 (正式写手)

[求助] 想询问一下“某基因”和“某基因-like”的差别? 跪求大神详细解答! 已有1人参与

如题,之前在NCBI blast时,就会发现这个问题,比如比对的结果会有:拟南芥TOC1基因、或者玉米的TOC1-like基因,
不过始终还是不明白有这个“-like”的基因和没有的基因具体有什么区别。
1、是“-like”的基因没有研究透彻?
2、是“-like”的基因的序列和没like基因的序列有细小差别?
3、还是“-like”的基因和无like的基因在功能上具有明显差别呢?

  因为之前的研究中不涉及到这样的问题,而目前的手里有条基因比对后出现了“-like”的标注,本身没有“-like”的基因具有重要功能,然而却没有比对出没有like的结果,如果研究这个"-like"的基因功能,就感觉觉得有点不可靠,请大神求教两者的区别,是否有必要研究“-like”基因的具体功能?
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

引用回帖:
4楼: Originally posted by soutree at 2014-10-15 09:27:17
一般来讲,如果在模式里发现了某基因,比如拟南芥Atxxx1,在其它物种中再发现的同源基因,命名不都是参考拟南芥的,比如白桦命名为Bpxxx1,还是有的人习惯命名为Bpxxx1-like呢? 还是说功能验证过的就命名为xxx1, ...

不确定就like
5楼2014-10-15 09:30:17
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反应链

新虫 (正式写手)

1. 序列高度同源;

2. 来源于不同物种;

3. 电子克隆的结果。
2楼2014-10-14 23:16:38
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
soutree(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-10-15 15:07:08
soutree: 金币+19, ★★★★★最佳答案 2014-10-16 12:10:25
同源基因的关系,一般是在某物种里发现某基因,然后在另外物种发现同源的基因,有时候就叫某基因-like
3楼2014-10-15 09:07:58
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soutree

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jurkat.1640 at 2014-10-15 09:07:58
同源基因的关系,一般是在某物种里发现某基因,然后在另外物种发现同源的基因,有时候就叫某基因-like

一般来讲,如果在模式里发现了某基因,比如拟南芥Atxxx1,在其它物种中再发现的同源基因,命名不都是参考拟南芥的,比如白桦命名为Bpxxx1,还是有的人习惯命名为Bpxxx1-like呢? 还是说功能验证过的就命名为xxx1,实验中附带的,没验证功能的就叫xxx-like呢?

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2014-10-15 09:27:17
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