24小时热门版块排行榜    

查看: 1830  |  回复: 7

dmtxbb

金虫 (正式写手)

[求助] 请问一下关于芯片分析中差异基因的问题。。。

就是芯片分析中,一般认定差异一倍的为显著的。但是要是差异基因多的话,有没有必要再多做一个或几个倍数呢?这个倍数有规定或者方法么
5倍,3倍,还是10倍?100倍,这个如何定呢,怎么定能更好的反应结果呢?还有这样分有木有必要啊?谢谢啊
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dmtxbb

金虫 (正式写手)

坐等学习
2楼2011-12-07 09:31:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

西瓜

荣誉版主 (知名作家)

差异是否显著,可以用统计学方法来分析。具体我也不懂,不过一般的统计学教材里面都有的。
3楼2011-12-08 21:33:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hailongqi

铁虫 (初入文坛)

小丹木木(金币+2): 鼓励交流 2012-02-22 09:04:23
一般芯片公司给的差异基因都是上下调一倍来计算的,这个是约定俗成的。所以差异基因可能比较多,考虑到芯片的误差以及数据分析的需要,你自己后面分析的时候肯定要进一步筛选差异基因,这个时候你可以把基因按照差异倍数从大到小排列,来选择感兴趣的基因。当然,是选择3倍,5倍还是10倍,这个筛选条件是你自己定,没有标准。
4楼2012-02-21 22:12:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

telomerase

至尊木虫 (著名写手)

cain

小丹木木(金币+2): 2012-02-22 09:05:10
是公司来算的,你想算得先自己下软件来分析,网上有软件,你可以下来看看。但主要你不是学数学这个的,所以不建议你自己分析。
好像华大有个在线分析,你把数据贴进去,他能按要求给你分析。

差异要求q-value(%)≤5,同时差异倍数即Fold Change控制在2倍以上,样本数≥3   但很多人说,q值要比Fold Change更准些。
我的路靠我的脚踩出来!!!不走寻常路!!!
5楼2012-02-22 08:51:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

telomerase

至尊木虫 (著名写手)

cain

是博奥,记错了
我的路靠我的脚踩出来!!!不走寻常路!!!
6楼2012-02-22 08:52:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

617004340

金虫 (小有名气)

生物信息学分析
7楼2012-11-07 21:09:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nicou

金虫 (小有名气)

如果没有设计重复,这个数据是不是就没什么意义了?至少发文章是不行了?
8楼2013-08-26 19:04:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 dmtxbb 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤?
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +20 koalala 2026-08-24 22/1100 2026-08-24 18:01 by Nano-Firefly
[基金申请] 人气不行了 +9 fansofjerry 2026-08-21 9/450 2026-08-24 17:48 by zhaozhengxin
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +6 图啦图啦 2026-08-24 6/300 2026-08-24 17:44 by 小小红帆
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +5 scalable 2026-08-24 5/250 2026-08-24 17:03 by spiderzhuzhi
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 21/1050 2026-08-24 14:21 by refreshing11
[基金申请] 我面上完蛋了 +8 且听虎啸 2026-08-20 9/450 2026-08-24 13:52 by zzuzxg
[基金申请] 朋友圈看到的 +7 wangzilk 2026-08-18 9/450 2026-08-24 10:50 by cmrandy
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 17/850 2026-08-24 10:20 by echo8914667
[基金申请] 明天应该可查了!? +4 chengyan1220 2026-08-23 4/200 2026-08-24 08:47 by gloomy6159
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见