24小时热门版块排行榜    

查看: 1842  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

dmtxbb

金虫 (正式写手)

[求助] 请问一下关于芯片分析中差异基因的问题。。。

就是芯片分析中,一般认定差异一倍的为显著的。但是要是差异基因多的话,有没有必要再多做一个或几个倍数呢?这个倍数有规定或者方法么
5倍,3倍,还是10倍?100倍,这个如何定呢,怎么定能更好的反应结果呢?还有这样分有木有必要啊?谢谢啊
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

telomerase

至尊木虫 (著名写手)

cain

小丹木木(金币+2): 2012-02-22 09:05:10
是公司来算的,你想算得先自己下软件来分析,网上有软件,你可以下来看看。但主要你不是学数学这个的,所以不建议你自己分析。
好像华大有个在线分析,你把数据贴进去,他能按要求给你分析。

差异要求q-value(%)≤5,同时差异倍数即Fold Change控制在2倍以上,样本数≥3   但很多人说,q值要比Fold Change更准些。
我的路靠我的脚踩出来!!!不走寻常路!!!
5楼2012-02-22 08:51:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

西瓜

荣誉版主 (知名作家)

差异是否显著,可以用统计学方法来分析。具体我也不懂,不过一般的统计学教材里面都有的。
3楼2011-12-08 21:33:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hailongqi

铁虫 (初入文坛)

小丹木木(金币+2): 鼓励交流 2012-02-22 09:04:23
一般芯片公司给的差异基因都是上下调一倍来计算的,这个是约定俗成的。所以差异基因可能比较多,考虑到芯片的误差以及数据分析的需要,你自己后面分析的时候肯定要进一步筛选差异基因,这个时候你可以把基因按照差异倍数从大到小排列,来选择感兴趣的基因。当然,是选择3倍,5倍还是10倍,这个筛选条件是你自己定,没有标准。
4楼2012-02-21 22:12:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nicou

金虫 (小有名气)

如果没有设计重复,这个数据是不是就没什么意义了?至少发文章是不行了?
8楼2013-08-26 19:04:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国自然评审意见 +11 wangmingqi 2026-08-28 15/750 2026-08-29 00:17 by fangyl2005
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +3 德尚中行 2026-08-27 3/150 2026-08-28 15:24 by rongshuxia
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +3 bud_bud 2026-08-27 6/300 2026-08-28 11:53 by bud_bud
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
请填处理意见