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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 求助！！怎样找同源蛋白！！
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wong丶

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助！！怎样找同源蛋白！！ 已有3人参与

本人是初学者，现在在做一个对草菇系统分类的论文，其中要比对鹅膏菌科、伞菌科和光柄菇三个科下的几个物种的同源蛋白序列，我要怎样才能找到它们的同源蛋白呢？有没有哪位好心人可以教教我，无限感激啊！！！
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1楼 2014-10-09 11:35:59
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wong丶

新虫 (初入文坛)
现在只给定了草菇这个物种，没有目标蛋白，我要怎样才能找到并确定这个目标蛋白呢？
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2楼2014-10-09 11:38:21
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 鼓励交流 2014-10-11 11:21:08
wong丶: 金币+5 2014-12-18 17:06:19
先在NCBI找到你的基因的蛋白质序列，再用BLAST找同源蛋白。
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3楼2014-10-11 10:43:02
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wong丶

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jurkat.1640 at 2014-10-11 10:43:02
先在NCBI找到你的基因的蛋白质序列，再用BLAST找同源蛋白。

现在只给定了草菇这个物种，没有目标基因或蛋白，要从哪里下手？
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4楼2014-10-13 16:51:58
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)
引用回帖:
4楼: Originally posted by wong丶 at 2014-10-13 16:51:58
现在只给定了草菇这个物种，没有目标基因或蛋白，要从哪里下手？...

先找草菇的文章，看看有哪些基因研究过。
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5楼2014-10-13 16:58:58
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

可以去Uniprot去下载proteome，然后BLAST
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6楼2014-10-14 06:21:04
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wong丶

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by jurkat.1640 at 2014-10-13 16:58:58
先找草菇的文章，看看有哪些基因研究过。...

那要是没有人研究过是不是就做不下去了呢
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7楼2014-10-14 15:29:25
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happydove

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

肯定有吧，要不就不会让你做了
即使没有具体蛋白序列的，也会介绍研究的是哪些
然后根据你的实验目的，在uniprot里找到蛋白序列，再在NCBI里Blast找同源的
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8楼2014-10-14 17:27:17
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