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普队大四喜

新虫 (初入文坛)

[求助] 蛋白晶体结构疑问。 已有2人参与

从pdb网站上下载的蛋白晶体结构,有些蛋白是四聚体结构,每个亚基的结构都一样(有时候每个亚基会有少数几个氨基酸的差别),这样是说明这个蛋白在行使功能的时候是以四聚体的形式存在的?我们做分子对接的时候也需要用四聚体的结构进行?
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younghe

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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普队大四喜: 金币+1, 有帮助 2014-05-19 21:36:07
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流! 2014-05-30 18:57:01
一般可能是一个晶胞里面packing有四个分子,你看看那个晶胞参数吧,具体是几聚体功能要看文献的功能实验,个人觉得模拟单个分子就就可以了,除非是dimmer有function
2楼2014-05-17 14:45:53
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普队大四喜

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by younghe at 2014-05-17 14:45:53
一般可能是一个晶胞里面packing有四个分子,你看看那个晶胞参数吧,具体是几聚体功能要看文献的功能实验,个人觉得模拟单个分子就就可以了,除非是dimmer有function

还要请教一下,有没有那种情况,行使功能的蛋白是二聚体,蛋白的活性位点在两个亚基之间,而不是在单个亚基的内部。
3楼2014-05-18 14:22:45
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xuxm03

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-05-30 18:57:06
的确有这样的蛋白…甚至不同蛋白的作用界面形成酶活性中心

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2014-05-19 05:53:22
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普队大四喜

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by xuxm03 at 2014-05-19 05:53:22
的确有这样的蛋白…甚至不同蛋白的作用界面形成酶活性中心

这样的蛋白文献报道会多吗,能不能提供一个例子啊。谢谢。
5楼2014-05-19 10:23:18
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