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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】请教MS建立晶体结构问题
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dingwei8108

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请教MS建立晶体结构问题

请教各位高手，如何在MS中建立如下晶体结构，谢谢！

TITLE *Chalcopyrite-CuFeS2-[F4-3M] Burdick, C.L.;Ellis, J.H.[1917]
CELL 5.228000 5.228000 5.228000 90.000000 90.000000 90.000000
SPCGRP F -4 3 M
ATOM CU 1 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.500000
ATOM FE 1 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.500000
ATOM S 1 0.250000 0.250000 0.250000  
END
FINISH
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1楼 2011-01-06 16:38:11
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lbambool

木虫 (著名写手)
★ ★
zzy870720z(金币+2):谢谢指教 2011-01-06 22:30:47
dingwei8108(金币+2): 2011-01-07 09:46:38
看一下帮助吧，不难的，先build-crystals---build crystal,按下面 5.228000 5.228000 5.228000晶胞参数构建，
F -4 3 M 空间群
然后add atom,按给定的原子坐标，一个一个一加进去就行了
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2楼2011-01-06 21:46:29
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)
★
youzhizhe(金币+1):谢谢交流。呵呵。 2011-01-06 22:56:15
楼上正解
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3楼2011-01-06 21:48:21
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dingwei8108

银虫 (小有名气)

请教

引用回帖:
Originally posted by lbambool at 2011-01-06 21:46:29:
看一下帮助吧，不难的，先build-crystals---build crystal,按下面 5.228000 5.228000 5.228000晶胞参数构建，
F -4 3 M 空间群
然后add atom,按给定的原子坐标，一个一个一加进去就行了

但是，Fe和Cu的原子坐标相冲突啊？咋整呢？
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4楼2011-01-07 09:47:48
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lbambool

木虫 (著名写手)
★ ★
dingwei8108(金币+8): 2011-01-07 10:10:52
zzy870720z(金币+2):谢谢指教 2011-01-07 12:08:28
看你了，应该有两种方法处理，一种是改占位，occupancy设为 0.5（坐标数据最后一个数），这样这个位置就由两种元素占有，各占50%，还有一种方法应该是先加入一种原子，再建超胞，取消对称性后用另一种原子替换掉50%的第一种原子。你看你的体系用哪种更合理，也许还有别的方法吧，我没这样用过，但应该可以这样操作，试一下或查一下文献看别人的处理方法。
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5楼2011-01-07 10:01:26
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lansingfly

金虫 (正式写手)
我也是遇到了同样的问题，正如“lbambool”所说，但替代的时候如果存在好几种不等价位置应该选择哪一个比较好呢。
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6楼2013-06-06 15:43:00
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夏陌86℃

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by lbambool at 2011-01-06 21:46:29
看一下帮助吧，不难的，先build-crystals---build crystal,按下面 5.228000 5.228000 5.228000晶胞参数构建，
F -4 3 M 空间群
然后add atom,按给定的原子坐标，一个一个一加进去就行了

求助，选取Fe(001)晶面，构建厚度为11层的表面体系，体积大小为3.1530x3.1530x2.0032.请问最后一句体积大小为3.1530x3.1530x2.0032怎么设置构建参数呢
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7楼2014-06-11 18:32:29
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微露晨曦yq

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by lbambool at 2011-01-07 10:01:26
看你了，应该有两种方法处理，一种是改占位，occupancy设为 0.5（坐标数据最后一个数），这样这个位置就由两种元素占有，各占50%，还有一种方法应该是先加入一种原子，再建超胞，取消对称性后用另一种原子替换掉50% ...

如果直接点yes，是否原来位置上的原子会被覆盖掉
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8楼2014-09-28 18:24:01
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hesi12520

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by 夏陌86℃ at 2014-06-11 18:32:29
求助，选取Fe(001)晶面，构建厚度为11层的表面体系，体积大小为3.1530x3.1530x2.0032.请问最后一句体积大小为3.1530x3.1530x2.0032怎么设置构建参数呢...

楼主解决了吗，求教
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9楼2016-01-03 10:58:59
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