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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 【求助】国内做蛋白质核磁共振和X晶体衍射的单位
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叔扬

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】国内做蛋白质核磁共振和X晶体衍射的单位已有3人参与

现须研究一个蛋白质的结构，请问国内分别有哪些单位可以做蛋白质的核磁共振和X晶体衍射？多谢帮助！
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小子无识
1楼2010-07-29 09:28:37
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nmrservice

捐助贵宾 (著名写手)
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wsht212(金币+2):谢谢交流，希望常来！ 2010-07-30 08:59:40
做蛋白质的核磁共振主要有中国科技大学，中科院武汉物理与数学所，生物物理所，厦门大学，北京大学等
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2楼2010-07-29 19:33:02
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

到底是谁第一个发表SARS冠状病毒主要蛋白酶晶体结构和抑制剂

★ ★ ★ ★
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wsht212(金币+3):谢谢交流 2010-07-30 09:19:11
作者：Snoopy

　　昨日看到何士刚先生的《良禽择木而栖》，提到饶子和院士对SARS 研究的重大贡献，不禁有些疑惑。文中说“1996年从英国Oxford大学回到清华大学的饶子和，在蛋白质晶体结构研究上作出了重要贡献，第一个解出了 SARS冠状病毒主要蛋白酶和其抑制剂的晶体结构。现为中国科学院院士，中国科学院生物物理研究所所长。”

　　据我所知，这项功劳应该归功于现任德国吕贝克大学生物化学所所长的Rolf Hilgenfeld 教授。他的研究组从1998 年就与德国南部的医药公司合作开发治疗流行性感冒的药物，开始对流感冠状病毒主要蛋白酶的晶体结构进行研究，通过计算机模拟筛选可能的抗病毒药物。在 SARS爆发之前，他们已经成功地构建了流感冠状病毒主要蛋白酶的晶体结构[1]，还筛选出了几个小分子药物，由医药公司着手进行前期试验。
　　这种计算机辅助的药物筛选法在世界各地的药物开发研究中早已得到广泛应用。不同的研究组各有侧重， 针对不同的药物靶点，因此Hilgenfeld 教授在SARS爆发前并非十分突出。例如吕贝克大学化学所的另一位教授也采用同样的思路对肝炎病毒主要蛋白酶进行研究。
　　SARS的流行是中国人的一场大难， 但却给Hilgenfeld 教授带来巨大的契机。主要从事这项研究的博士生Anand 历经5年才完成蛋白表达、结晶、建立计算机模型和几个小分子筛选。 当确定SARS病原后，他们欣喜地发现SARS冠状病毒主要蛋白酶的结构与他们已经构建好的流感冠状病毒主要蛋白酶只有几个氨基酸的差异，于是用稍作修改的已有模型马上开始筛选。这就是为什么确定病原之后，他们马上就能在Science 上发表轰动性的成果的原因。“机遇只偏爱有准备的头脑”，Hilgenfeld 教授的经历就是这句话最好的印证。
　　加拿大科学家在2003年4月12日首先宣布解出冠狀病毒的基因序列，Hilgenfeld 教授的文章发表于2003 年5月[2]， 饶院士的论文是与Hilgenfeld 教授合作后发表于2003年10月[3]。如果没有Hilgenfeld 小组以前的工作积累，试问饶院士真能在几个月时间内完成这么多工作吗？虽说发了篇PNAS，可说到底也还只是步人后尘，何况还是与原作者合作的产物。
　　如果大家有兴趣比较一下中文和英文古狗搜索“SARS，病毒主要蛋白酶”，就会发现中文媒体满篇皆是“饶子和教授首先发现......”云云，英文媒体则只提到过Hilgenfeld 教授。如果真象他们自己吹嘘的那样，为什么关于这项研究的大奖颁给印度博士生Anand K， 而没有发给贡献杰出的清华高材生呢？
　　其实，我并非第一次听到这种他们第一的说法，只是因为此话出于饶院士高徒之口，我认为弟子难免为导师吹嘘，也就罢了。可是何士刚先生一向严谨，我觉得有必要说个清楚。饶院士在国内是学界泰斗，正因为如此自我宣传时更应该实事求是。您在中国比Hilgenfeld 教授不知神气多少倍，何必还要用这种移花接木的手段呢。

1、Anand K, Palm GJ, Mesters JR, Siddell SG, Ziebuhr J, Hilgenfeld R. Structure of coronavirus main proteinase reveals combination of a chymotrypsin fold with an extra alpha-helical domain. EMBO J. 2002 Jul 1;21(13):3213-24.

2、Anand K, Ziebuhr J, Wadhwani P, Mesters JR, Hilgenfeld R. Coronavirus main proteinase (3CLpro) structure: basis for design of anti-SARS drugs. Science. 2003 Jun 13;300(5626):1763-7. Epub 2003 May 13.

3、Yang H, Yang M, Ding Y, Liu Y, Lou Z, Zhou Z, Sun L, Mo L, Ye S, Pang H, Gao GF, Anand K, Bartlam M, Hilgenfeld R, Rao Z. The crystal structures of severe acute respiratory syndrome virus main protease and its complex with an inhibitor. Proc Natl Acad Sci U S A. 2003 Nov 11;100(23):13190-5. Epub 2003 Oct 29.
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3楼2010-07-29 20:22:13
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

评《到底是谁第一个发表SARS冠状病毒主要蛋白酶晶体结构和抑制剂》

★ ★
wsht212(金币+2):谢谢交流，希望常来！ 2010-07-30 09:19:36
SARS冠状病毒蛋白酶确实由饶子和与Hilgenfeld共同首先解得并发表

因为Hilgenfeld于2003年5月在Science上发表的是模拟的SARS冠状病毒蛋白酶的结构。真正的结构几个月后才在PNAS上发表。我不解的是为什么饶子和要和Hilgenfeld合作？合作中各自的角色是什么？
（JZ）

从 Hilgenfeld 的排名以及非通讯作者，很可能 Hilgenfeld 只是给于了一些不太重要的帮助。当然，Hilgenfeld 的science文章对饶子和文章发表的重要性是不言而喻的，但因此把全部的功劳归功于 Hilgenfeld而否定饶子和的工作，实在有点荒唐，难道说发现 PCR 的功劳应该全部给 DNA 聚合酶的发现者？Hilgenfeld 的功劳就在science文章，仅此而
已。
（xysReader）

也没什么不妥

如果同源蛋白被解出来了，你再去做类似的工作，除非结构上有显著区别，否则根本无意义。读一下Hilgenfeld和饶的文章就知道饶是在依葫芦画瓢。发PNAS已经是沾光了。
（tomoe）
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4楼2010-07-29 20:22:35
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★ ★ ★
wsht212(金币+3):好好看看学习一下 2010-07-30 09:20:15
http://xys4.dxiong.com/xys/ebook ... dajia5/raozihe4.txt

对《到底是谁第一个发表SARS冠状病毒主要蛋白酶晶体结构和抑制剂》的几点商榷

作者：Xneuron

看了Snoopy的《到底是谁第一个发表SARS冠状病毒主要蛋白酶晶体结构和抑制剂》，觉得有些地方值得商榷。

1）文章中提到“当确定SARS病原后，他们欣喜地发现SARS冠状病毒主要蛋白酶的结构与他们已经构建好的流感冠状病毒主要蛋白酶只有几个氨基酸的差异，于是用稍作修改的已有模型马上开始筛选”。

这个地方显然是有问题的！在Hilgenfeld的Science文章中，他们解析了人类冠状病毒229E Mpro和猪肠胃炎冠状病毒229E Mpro抑制剂复合物的晶体结构。文中还提到229E Mpro 和229E Mpro与SARS冠状病毒（他们表达的是TOR2株）的氨基酸序列一致性分别只有40％和44％。以229E Mpro为例，其分子量为33.1-kD，怎么着也得100个左右氨基酸的差别吧？怎么会是只有几个氨基酸的差异！？做一下blast，也会得出同样的结果！

2）这两个蛋白有同源性，可以看作是一个家族的（rao的文章中提到了这一点）；他们三维结构的确也非常相似，但是在SARS水解酶蛋白结构解析出来以前，没人可以肯定地下结论，而且Rao实验室还做了Complex的结构，发现酶与底物的结合是一种全新的方式，与Rolf他们做的并不相同，所以他们文章发了以后，PNAS会为此专门开新闻发布会。另外，Hilgenfeld他们只是根据他们解析的上面提到的蛋白的结构，构建了SARS病毒的同源性模型（可能而已）！

3）  在Rao的文章中，提到“Our crystal structures provide, to our knowledge, the first view of this viral protease, including the active site conformation.”！请注意，Hilgenfeld也是这篇文章的作者之一，他应该是看过这篇文章的，他没有提出异议，那么起码我们可以认为，他不反对如此的表述，对不对？原作者都没有异议，看来snoopy该是打抱不平的了，呵呵！

4） 印度博士生Anand K获得的那个大奖是什么大奖？我google了一下，是不是Fonda-Fasella Award？这是什么样子的大奖？是欧洲的某个奖项？要不要申请？我真的不是很明白！而且似乎获奖者是在11月份左右确定的？剔除国别和人种歧视的因素，评奖的时机该不是特别利于rao实验室的那位清华高才生吧？当然，我不是说rao他们理应得奖，只是觉得觉得snoopy兄说得有失偏颇而已！

总之，我认为，这项荣誉归于rao实验室是可以接受的，起码是他们，而不是某个外国人或是机构，最先直接解析了人类SARS病毒的结构！

[ Last edited by yalefield on 2010-7-29 at 20:24 ]
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5楼2010-07-29 20:23:22
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叔扬

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by nmrservice at 2010-07-29 19:33:02:
做蛋白质的核磁共振主要有中国科技大学，中科院武汉物理与数学所，生物物理所，厦门大学，北京大学等

多谢指点，真的很感谢，祝您平安顺利！
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小子无识
6楼2010-07-30 10:37:58
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