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discover之后如何提取轨迹坐标?
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discover之后如何提取轨迹坐标?
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水分子discover运行之后,如何提取每个原子在每一帧的坐标?急急急,求解答
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1楼
2014-10-09 09:01:06
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6楼
:
Originally posted by
夏陌86℃
at 2014-11-10 16:52:58
请教您一个问题:
我做的是有机分子在金属表面的吸附,用discover--minimize后进行dynamic总是会失败,结果中会出现:
Error: Dynamic: Energy differennce between successive steps in dynamic is greater tha ...
这个错误没出现过哦,会不会是设置操作的问题呢
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7楼
2014-11-10 18:38:37
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2014-11-21 14:18:03
轨迹坐标还是原子的坐标,不知道提取原子的坐标是做什么用的,是否可以用分子的坐标来间接表示。
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2楼
2014-10-09 11:31:07
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2楼
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Originally posted by
CQU_wjq
at 2014-10-09 11:31:07
轨迹坐标还是原子的坐标,不知道提取原子的坐标是做什么用的,是否可以用分子的坐标来间接表示。
原子坐标,不过分子坐标又该怎么表示?谢谢
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3楼
2014-10-10 08:17:29
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Originally posted by
mxbn55
at 2014-10-10 08:17:29
原子坐标,不过分子坐标又该怎么表示?谢谢...
原子坐标和分子电荷中心、几何中心在Properties里面就有显示,不过所有的坐标统计就不晓得在哪弄了,用这些坐标干什么是最关键的,几个还可以一个个统计,如果很多的话就用分布统计就行了,应该没必要统计每个原子的坐标。
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4楼
2014-10-10 09:11:37
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