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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS的QSAR模块使用
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bemy1004

银虫 (小有名气)

[求助] MS的QSAR模块使用

各位大神，本人是工科学生，专业是模式识别。最近在做老板的项目需要用到MS软件的QSAR模块，但是我对该模块很不熟悉，不太会用，周围也基本没有使用过该模块的老师同学。所以想请教各位，能否赐教？20枚大虫币立即奉上！
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1楼 2013-07-22 16:09:55
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-11-21 15:20:24
MS的help里面有QSAR模块的介绍，英文的，要耐心点看
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2013-07-22 16:53:48
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2013-11-21 15:20:30
百度百科有个QSAR的介绍，可以了解下QSAR可以做什么

http://baike.baidu.com/view/331668.htm
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
3楼2013-07-22 16:55:48
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bemy1004

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by pigrass at 2013-07-22 16:55:48
百度百科有个QSAR的介绍，可以了解下QSAR可以做什么

http://baike.baidu.com/view/331668.htm

我需要从QSAR中得到某种化合物的描述符，看了MS的教程不是太理解。
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4楼2013-07-22 21:06:58
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-07-24 17:01:46
bemy1004: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-07-24 19:53:15
引用回帖:
4楼: Originally posted by bemy1004 at 2013-07-22 21:06:58
我需要从QSAR中得到某种化合物的描述符，看了MS的教程不是太理解。...

找到一片可能对你有用的文献
QSAR方法，理论化学描述符预测多氯联苯的贝类净化

我对你说的模式识别不了解

我对QSAR的理解就是这个模块【或者说方法】可以根据结构计算出分子的性质【所谓的描述符？比如均方末端距、分子极化率、电荷分布等等】

利用统计学，找到描述符与宏观性质【化学反应活性、硬度、熔点、溶解度等等】的相关性
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  • 附件 1 : 利用理论化学描述符预测多氯联苯的贝类净化.pdf
    • 2013-07-24 14:26:03, 573.12 K
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
5楼2013-07-24 14:32:08
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bemy1004

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by pigrass at 2013-07-24 14:32:08
找到一片可能对你有用的文献
QSAR方法，理论化学描述符预测多氯联苯的贝类净化

我对你说的模式识别不了解

我对QSAR的理解就是这个模块【或者说方法】可以根据结构计算出分子的性质【所谓的描述符？比如均方 ...

先谢谢了，你的这篇文章还是有用的。但是我对利用软件的QSAR功能求分子的描述符还是不太清楚。我是学控制的，方向是hi模式识别。
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6楼2013-07-24 19:56:06
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
6楼: Originally posted by bemy1004 at 2013-07-24 19:56:06
先谢谢了，你的这篇文章还是有用的。但是我对利用软件的QSAR功能求分子的描述符还是不太清楚。我是学控制的，方向是hi模式识别。...

要说计算原理，这个真不知道。要说操作，真是画个模型点几下鼠标的事

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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7楼2013-07-25 07:28:16
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bemy1004

银虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by pigrass at 2013-07-25 07:28:16
要说计算原理，这个真不知道。要说操作，真是画个模型点几下鼠标的事
...

你是用MS软件操作的吗？如果是的话，能否帮忙画一个模型并且计算一下（描述符）吗？
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8楼2013-07-26 21:46:05
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
bemy1004: 金币+15, ★★★很有帮助, 对我帮助实在是太大了，感谢！ 2013-07-29 15:34:07
月只蓝: 金币+5, 应助指数+1, 感谢耐心指导！ 2013-11-21 15:21:03
引用回帖:
8楼: Originally posted by bemy1004 at 2013-07-26 21:46:05
你是用MS软件操作的吗？如果是的话，能否帮忙画一个模型并且计算一下（描述符）吗？...

MS的tutorials自带一个不同corrosion的描述符计算【descriptor calculations】示例

结果导出为csv格式，可以excel打开，如附件所示
蓝色圈出部分为事例计算的各种描述符，我对这方面了解不多，没仔细看各描述符是什么意思

按示例来说，就是建个合理模型【当然，示例里面是直接导入内置的模型】，点QSAR模块，挑选需要的描述符，然后计算机就自动计算出来结果了

MS的QSAR模块使用
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  • 附件 1 : CI.csv
    • 2013-07-26 22:17:18, 8.62 K
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9楼2013-07-26 22:22:54
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bemy1004

银虫 (小有名气)
真的非常感激你，你的指点对我的帮助很大，对这个已经有了基本的认识了，再次感谢！
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10楼2013-07-29 15:33:24
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