24小时热门版块排行榜    

查看: 1151  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

mxbn55

金虫 (小有名气)

[求助] discover之后如何提取轨迹坐标? 已有1人参与

水分子discover运行之后,如何提取每个原子在每一帧的坐标?急急急,求解答
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mxbn55

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by CQU_wjq at 2014-10-09 11:31:07
轨迹坐标还是原子的坐标,不知道提取原子的坐标是做什么用的,是否可以用分子的坐标来间接表示。

原子坐标,不过分子坐标又该怎么表示?谢谢
3楼2014-10-10 08:17:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

CQU_wjq

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
mxbn55: 金币+20 2014-11-21 14:18:03
轨迹坐标还是原子的坐标,不知道提取原子的坐标是做什么用的,是否可以用分子的坐标来间接表示。
逆风奔跑。
2楼2014-10-09 11:31:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CQU_wjq

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by mxbn55 at 2014-10-10 08:17:29
原子坐标,不过分子坐标又该怎么表示?谢谢...

原子坐标和分子电荷中心、几何中心在Properties里面就有显示,不过所有的坐标统计就不晓得在哪弄了,用这些坐标干什么是最关键的,几个还可以一个个统计,如果很多的话就用分布统计就行了,应该没必要统计每个原子的坐标。
逆风奔跑。
4楼2014-10-10 09:11:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mxbn55

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by CQU_wjq at 2014-10-10 09:11:37
原子坐标和分子电荷中心、几何中心在Properties里面就有显示,不过所有的坐标统计就不晓得在哪弄了,用这些坐标干什么是最关键的,几个还可以一个个统计,如果很多的话就用分布统计就行了,应该没必要统计每个原子 ...

我要这些坐标主要是为了检测周期性边界的真正含义。将这些分子的坐标找到,利用matlab计算轨迹,运用扩散系数的公式验证和MS软件算出来的扩散系数对比,来检测分子跑出盒子与周期性边界的关系。
5楼2014-10-20 13:11:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂院校信息 +4 CX 330 2026-03-21 4/200 2026-03-21 23:48 by ms629
[考研] 一志愿北京化工大学070300 学硕336求调剂 +3 vv迷 2026-03-21 4/200 2026-03-21 23:05 by f19980501
[考研] 化学工程321分求调剂 +18 大米饭! 2026-03-15 22/1100 2026-03-21 20:20 by HH领袖
[考研] 0703化学调剂 +4 妮妮ninicgb 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:39 by 学员8dgXkO
[考研] 生物学调剂 +3 Surekei 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:31 by 学员8dgXkO
[考研] 297求调剂 +11 戏精丹丹丹 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:47 by ColorlessPI
[考研] 306求调剂 +4 chuanzhu川烛 2026-03-18 4/200 2026-03-21 08:25 by laoshidan
[考研] 初始318分求调剂(有工作经验) +3 1911236844 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:33 by JourneyLucky
[考研] 332求调剂 +4 ydfyh 2026-03-17 4/200 2026-03-21 02:20 by JourneyLucky
[考研] 271材料工程求调剂 +8 .6lL 2026-03-18 8/400 2026-03-21 00:58 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂 +5 西南交通专材355 2026-03-19 5/250 2026-03-20 21:10 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西安交通大学 学硕 354求调剂211或者双一流 +3 我想要读研究生 2026-03-20 3/150 2026-03-20 20:13 by JourneyLucky
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +7 困于星晨 2026-03-17 9/450 2026-03-20 17:38 by 无懈可击111
[考研] 材料与化工求调剂 +7 为学666 2026-03-16 7/350 2026-03-19 14:48 by 尽舜尧1
[考研] 344求调剂 +6 knight344 2026-03-16 7/350 2026-03-18 20:13 by walc
[考研] 085601专硕,总分342求调剂,地区不限 +5 share_joy 2026-03-16 5/250 2026-03-18 14:48 by haxia
[考研] 293求调剂 +11 zjl的号 2026-03-16 16/800 2026-03-18 08:10 by zhukairuo
[考研] 290求调剂 +3 p asserby. 2026-03-15 4/200 2026-03-17 16:35 by wangkm
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
[考研] 一志愿,福州大学材料专硕339分求调剂 +3 木子momo青争 2026-03-15 3/150 2026-03-17 07:52 by laoshidan
信息提示
请填处理意见