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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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wungung

金虫 (初入文坛)

[求助] 请教:如何用Gromacs计算脂水分配系数 已有1人参与

求助各位同门:
我想用Gromacs计算一种分子在水和正辛醇之间的分配系数,我建了一个盒子装入了水、正辛醇、该分子,进行了能量最小化和长程动力学。之后不知该怎样进行分析才能计算出分子在两相之间的分配数目。
还望各位师兄师姐们不吝赐教呀!
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smutao

禁虫 (著名写手)

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4楼2014-10-08 21:54:11
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smutao

禁虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wungung: 金币+5, 求继续帮助! 2014-10-08 14:11:26
本帖内容被屏蔽

2楼2014-10-08 10:44:57
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wungung

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-10-08 10:44:57
您说的是logP吧
????

是的呀!
请问您知道怎样用Gromacs的分析命令来计算吗?
求指点!!!!!!
3楼2014-10-08 13:28:53
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wungung

金虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by smutao at 2014-10-08 21:54:11
我没有用md算过logP
logP应该是实验测得的

那您知道如何用Gromacs计算两相中的分子个数吗?
5楼2014-10-09 08:39:34
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