应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 请教：如何用Gromacs计算脂水分配系数
51/1返回列表
查看: 706  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

wungung

金虫 (初入文坛)

[求助] 请教：如何用Gromacs计算脂水分配系数 已有1人参与

求助各位同门：
我想用Gromacs计算一种分子在水和正辛醇之间的分配系数，我建了一个盒子装入了水、正辛醇、该分子，进行了能量最小化和长程动力学。之后不知该怎样进行分析才能计算出分子在两相之间的分配数目。
还望各位师兄师姐们不吝赐教呀！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-10-08 09:50:53
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

smutao

禁虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wungung: 金币+5, 求继续帮助！ 2014-10-08 14:11:26
本帖内容被屏蔽
2楼2014-10-08 10:44:57
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wungung

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-10-08 10:44:57
您说的是logP吧
？？？？

是的呀！
请问您知道怎样用Gromacs的分析命令来计算吗？
求指点！！！！！！
赞一下 回复此楼
3楼2014-10-08 13:28:53
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

smutao

禁虫 (著名写手)
本帖内容被屏蔽

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

wungung
4楼2014-10-08 21:54:11
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wungung

金虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by smutao at 2014-10-08 21:54:11
我没有用md算过logP
logP应该是实验测得的

那您知道如何用Gromacs计算两相中的分子个数吗？
赞一下 回复此楼
5楼2014-10-09 08:39:34
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wungung 的主题更新
51/1返回列表
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭